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wangchen1995

铁虫 (初入文坛)

[求助] 询问关于分子动力学模拟的教材? 已有2人参与

这几天,在用lammps来模拟问题。在使用过程中,感觉对一些基本概念理解的不是太清晰(之前只是了解过分子动力学模拟的东西,但不是太系统的掌握)。所以,希望大家推荐一本关于分子动力学模拟的书,能基础并且系统的讲解分子动力学模拟过程的一些方法手段,最好不要只说书名,尽量把你推荐书的优缺点说一下。
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戴世杰

木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by liuzhu0706 at 2014-10-09 18:00:26
大赞此回答,特别详细...

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[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2014-11-02 10:06:52
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查看全部 7 个回答

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

一般是看陈正隆的书,对分子模拟有个大概的了解,然后学软件 的help,help里一般有专业术语介绍和操作方法
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2014-10-08 08:49:56
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cara-meng

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你看看《分子模拟基础》李永健的。希望对你有用。
3楼2014-10-08 17:13:43
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luzihen

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果你觉得对很多术语不了解,我建议直接wiki。
如果想系统得掌握MD,知道它的长短,我觉以下内容是必要的:
1.热力学,为什么,因为这个东西我觉得是最基础的,热力学的东西以前只能靠实验做出来,现在多了新的方法,就是MD。推荐的书当然是Atkin‘s的物理化学。从宏观到微观和从微观到宏观两种讲法讲了热力学。其实读完了基本也不读太多别的了。很厚很厚的书。
2.统计物理,你那些系宗哪里来的,就这里来的。这个是理解的好工具。看书的话就孙汝铿的那本。
3.力学,你可能觉得没必要,但是如果压了解Nose-Hoover调压方法和很多别的文献中的新方法,需要对拉格朗日力学有一些了解,推荐朗道的力学。很薄的一本,天把天看完。
4.具体到分子模拟的话,首选的一本是computer simulation of liquids,经典书籍,很细的书,不是泛泛的介绍,读完对每一步干了什么都会比较了解。不过这本书我觉得比较难啃,最好有了上面的基础再来读这个。
5. 我老板推荐给我入门的书是Introduction to Practice of Molecular Simulation...简单易懂。。。我看的时候什么也不懂。。。也能看
6.最好懂点量子力学基础,知道Classical MD,Ab initio MD的区别。这个的话推荐一本老板推荐给我的Ab Initio Molecular Dynamics Basic Theory and Advanced Methods,这个你不做AIMD的话就读个第一章第二章就行了。
4楼2014-10-08 21:45:55
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