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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 询问关于分子动力学模拟的教材？
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wangchen1995

铁虫 (初入文坛)

[求助] 询问关于分子动力学模拟的教材？ 已有2人参与

这几天，在用lammps来模拟问题。在使用过程中，感觉对一些基本概念理解的不是太清晰（之前只是了解过分子动力学模拟的东西，但不是太系统的掌握）。所以，希望大家推荐一本关于分子动力学模拟的书，能基础并且系统的讲解分子动力学模拟过程的一些方法手段，最好不要只说书名，尽量把你推荐书的优缺点说一下。
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1楼 2014-10-07 21:40:05
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cara-meng

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你看看《分子模拟基础》李永健的。希望对你有用。
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3楼2014-10-08 17:13:43
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
一般是看陈正隆的书，对分子模拟有个大概的了解，然后学软件 的help，help里一般有专业术语介绍和操作方法
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2014-10-08 08:49:56
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luzihen

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
如果你觉得对很多术语不了解，我建议直接wiki。
如果想系统得掌握MD，知道它的长短，我觉以下内容是必要的：
1.热力学，为什么，因为这个东西我觉得是最基础的，热力学的东西以前只能靠实验做出来，现在多了新的方法，就是MD。推荐的书当然是Atkin‘s的物理化学。从宏观到微观和从微观到宏观两种讲法讲了热力学。其实读完了基本也不读太多别的了。很厚很厚的书。
2.统计物理，你那些系宗哪里来的，就这里来的。这个是理解的好工具。看书的话就孙汝铿的那本。
3.力学，你可能觉得没必要，但是如果压了解Nose-Hoover调压方法和很多别的文献中的新方法，需要对拉格朗日力学有一些了解，推荐朗道的力学。很薄的一本，天把天看完。
4.具体到分子模拟的话，首选的一本是computer simulation of liquids,经典书籍，很细的书，不是泛泛的介绍，读完对每一步干了什么都会比较了解。不过这本书我觉得比较难啃，最好有了上面的基础再来读这个。
5. 我老板推荐给我入门的书是Introduction to Practice of Molecular Simulation...简单易懂。。。我看的时候什么也不懂。。。也能看
6.最好懂点量子力学基础，知道Classical MD,Ab initio MD的区别。这个的话推荐一本老板推荐给我的Ab Initio Molecular Dynamics Basic Theory and Advanced Methods，这个你不做AIMD的话就读个第一章第二章就行了。
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4楼2014-10-08 21:45:55
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匿名

用户注销 (正式写手)
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5楼2014-10-09 18:00:26
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