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询问关于分子动力学模拟的教材？ 已有2人参与
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| 这几天，在用lammps来模拟问题。在使用过程中，感觉对一些基本概念理解的不是太清晰（之前只是了解过分子动力学模拟的东西，但不是太系统的掌握）。所以，希望大家推荐一本关于分子动力学模拟的书，能基础并且系统的讲解分子动力学模拟过程的一些方法手段，最好不要只说书名，尽量把你推荐书的优缺点说一下。 |
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pigrass
专家顾问 (著名写手)
伊卡斯特的小猪
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专家经验: +503 - 模拟EPI: 4
- 应助: 377 (硕士)
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- 注册: 2011-10-27
- 性别: GG
- 专业: 高分子材料结构与性能
- 管辖: 分子模拟
2楼2014-10-08 08:49:56
3楼2014-10-08 17:13:43
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
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如果你觉得对很多术语不了解，我建议直接wiki。 如果想系统得掌握MD，知道它的长短，我觉以下内容是必要的： 1.热力学，为什么，因为这个东西我觉得是最基础的，热力学的东西以前只能靠实验做出来，现在多了新的方法，就是MD。推荐的书当然是Atkin‘s的物理化学。从宏观到微观和从微观到宏观两种讲法讲了热力学。其实读完了基本也不读太多别的了。很厚很厚的书。 2.统计物理，你那些系宗哪里来的，就这里来的。这个是理解的好工具。看书的话就孙汝铿的那本。 3.力学，你可能觉得没必要，但是如果压了解Nose-Hoover调压方法和很多别的文献中的新方法，需要对拉格朗日力学有一些了解，推荐朗道的力学。很薄的一本，天把天看完。 4.具体到分子模拟的话，首选的一本是computer simulation of liquids,经典书籍，很细的书，不是泛泛的介绍，读完对每一步干了什么都会比较了解。不过这本书我觉得比较难啃，最好有了上面的基础再来读这个。 5. 我老板推荐给我入门的书是Introduction to Practice of Molecular Simulation...简单易懂。。。我看的时候什么也不懂。。。也能看 6.最好懂点量子力学基础，知道Classical MD,Ab initio MD的区别。这个的话推荐一本老板推荐给我的Ab Initio Molecular Dynamics Basic Theory and Advanced Methods，这个你不做AIMD的话就读个第一章第二章就行了。 |
4楼2014-10-08 21:45:55
5楼2014-10-09 18:00:26
戴世杰
木虫 (著名写手)
- 应助: 103 (高中生)
- 金币: 4018.4
- 散金: 1099
- 红花: 18
- 帖子: 1218
- 在线: 745.7小时
- 虫号: 1275484
- 注册: 2011-04-23
- 专业: 食品加工技术
6楼2014-11-02 10:06:52
小蝴蝶ing
新虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 1382.2
- 红花: 2
- 帖子: 214
- 在线: 99.8小时
- 虫号: 3444308
- 注册: 2014-09-27
- 性别: GG
- 专业: 药物化学
7楼2014-11-03 21:19:03