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wxy1234yyf

金虫 (小有名气)

[求助] 关于体外转录 已有1人参与

想用不含sigma因子的核心酶做体外转录,再另加入不同sigma因子来确定是哪种sigma因子介导转录。如何优化条件?我做了几次全失败,希望高人传授一下经验。
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wxy1234yyf

金虫 (小有名气)

先把RNA核心酶(Epicenter)和sigma因子(已脱咪唑)孵育,37度10min,再加入以下试剂:
5xtranscription buffer (0.2M Tris-HCl,ph7.5; 0.75M KCl, 50mM MgCl2, 0.05% TritoonX-100)  5ul
NTP(10mM)  0.5ul
DIG-UTP: 0.5ul
50U RNase inhibitor: 0.5ul
BSA(10mg/ml): 0.25ul
肝素钠(12.5mg/ml): 0.5ul
DTT(0.2M): 0.25ul

加上500ng左右DNA模板,总体系25ul,37度反应20min。
RNA胶电泳无条带。

有些疑惑:
1. DNA模板是选用超螺旋质粒DNA还是PCR纯化的模板DNA
2. 查阅文献发现不同作者选用不同试剂,例如HEPES,谷氨酸钾,EDTA等等,不知对结果有什么影响
3楼2014-08-06 18:30:38
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gu666hong

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-08-06 18:15:30
你的体系和转录时间贴出来看看啊,还有转录以后的纯化以及鉴定你是怎么做的,都说下别人才好给你提意见啊
2楼2014-08-06 16:03:52
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wxy1234yyf

金虫 (小有名气)

RNA胶是转膜后DIG显影没有条带,什么都看不到。
4楼2014-08-06 18:41:01
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wxy1234yyf

金虫 (小有名气)

难道小木虫里做体外转录的人很少么……
5楼2014-08-12 08:45:39
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