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王芳边疆

金虫 (正式写手)

[求助] 已知引物序列，如何推算扩增后的片段大小？ 已有1人参与

您好：
    请问哪位大侠能够指导我通过已知的引物序列，推算扩增后的片段大小？
    我的引物序列分别为：Bact27f (5‘-GTTTGATCCTGGCTCAG-3’)和Lab-677r (5’-CACCGCTACACATGGAG-3’ )；谢谢大家的帮忙，万分感谢！
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温暖定格
1楼 2014-07-14 01:00:38
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王芳边疆

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 冉兆星 at 2014-07-14 08:58:05
这对引物难道不是根据模板设计的？没模板？还有你用的材料是哪种生物？

谢谢您的留言，我是P乳酸菌V2-V3区的片段，引物是参照参考文献的，但是令人失望的是，文献中并未介绍该片段的大小，所以想请教如何根据上述引物确定目的片段的大小？
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温暖定格
3楼2014-07-14 09:03:13
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冉兆星

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
王芳边疆(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-07-14 09:10:51
这对引物难道不是根据模板设计的？没模板？还有你用的材料是哪种生物？
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2楼2014-07-14 08:58:05
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冉兆星

木虫 (小有名气)
★
王芳边疆(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-07-15 18:55:17
引用回帖:
3楼: Originally posted by 王芳边疆 at 2014-07-14 09:03:13
谢谢您的留言，我是P乳酸菌V2-V3区的片段，引物是参照参考文献的，但是令人失望的是，文献中并未介绍该片段的大小，所以想请教如何根据上述引物确定目的片段的大小？...

如果物种是P乳酸菌（Lactobacillus plantarum strain），那么引物扩增的序列应该是16S ribosomal RNA gene。扩增长度是707bp。
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4楼2014-07-14 09:22:39
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王芳边疆

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 冉兆星 at 2014-07-14 09:22:39
如果物种是P乳酸菌（Lactobacillus plantarum strain），那么引物扩增的序列应该是16S ribosomal RNA gene。扩增长度是707bp。...

太感谢了。
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温暖定格
5楼2014-07-15 12:26:33
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