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yyang628

银虫 (初入文坛)

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[求助] 求助：如何批量获得基因的序列号已有1人参与

大家好！现在我需要从NCBI上批量获得基因的序列号，即有2千多个基因需要获得序列号（NCBI Reference Sequence），是号码，而不需要序列，现在只有gene symbol和对应的所属物种，如何获得对应的序列号，及其网址；就像http://www.bu.edu/nf-kb/gene-resources/target-genes/这里做的以NM_开头的序号。请大侠们帮帮忙，量太大了，不能手工处理吧

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1楼 2014-06-30 09:37:14

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飞约疯人院

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科学怪人

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流！ 2014-06-30 20:19:51

1，在PubMed搜索完成，
2，在Show后面的send to 后，选file，弹出框中Display后的格式改成MEDLINE，保存。
3，到Endnote，File-import-

Import Data file后，点choose file，找到刚才保存的文件，双击选中。
Import Option后，从下拉菜单选合适的Filter，这里是选PubMed（NLM）
（点Find会发现，提供了很多选项，要选择合适的，从comments里面可以看介绍。）
Duplicates是关于重复了的文献怎么处理的，可以选中Discard。
Text Translation：可以选No Translation。

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人生贵在行动，迟疑不决时，不妨先迈出小小一步。

2楼2014-06-30 10:07:25

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yyang628

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引用回帖:

2楼: Originally posted by 飞约疯人院 at 2014-06-30 10:07:25
1，在PubMed搜索完成，
2，在Show后面的send to 后，选file，弹出框中Display后的格式改成MEDLINE，保存。
3，到Endnote，File-import-

Import Data file后，点choose file，找到刚才保存的文件，双击选中。
...

我问的不是如何管理文献，是如何查找gene symbol对应的序列号（NCBI Reference Sequence）也即Accession Number

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3楼2014-06-30 18:53:12

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