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yyang628

银虫 (初入文坛)

[求助] 求助:如何批量获得基因的序列号 已有1人参与

大家好!现在我需要从NCBI上批量获得基因的序列号,即有2千多个基因需要获得序列号(NCBI Reference Sequence),是号码,而不需要序列,现在只有gene symbol和对应的所属物种,如何获得对应的序列号,及其网址;就像http://www.bu.edu/nf-kb/gene-resources/target-genes/这里做的以NM_开头的序号。请大侠们帮帮忙,量太大了,不能手工处理吧
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流! 2014-06-30 20:19:51
1,在PubMed搜索完成,
2,在Show后面的send to 后,选file,弹出框中Display后的格式改成MEDLINE,保存。
3,到Endnote,File-import-

Import Data file后,点choose file,找到刚才保存的文件,双击选中。
Import Option后,从下拉菜单选合适的Filter,这里是选PubMed(NLM)
(点Find会发现,提供了很多选项,要选择合适的,从comments里面可以看介绍。)
Duplicates是关于重复了的文献怎么处理的,可以选中Discard。
Text Translation:可以选No Translation。
人生贵在行动,迟疑不决时,不妨先迈出小小一步。
2楼2014-06-30 10:07:25
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yyang628

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 飞约疯人院 at 2014-06-30 10:07:25
1,在PubMed搜索完成,
2,在Show后面的send to 后,选file,弹出框中Display后的格式改成MEDLINE,保存。
3,到Endnote,File-import-

Import Data file后,点choose file,找到刚才保存的文件,双击选中。
...

我问的不是如何管理文献,是如何查找gene symbol对应的序列号(NCBI Reference Sequence)也即Accession Number
3楼2014-06-30 18:53:12
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jocking2000

铁虫 (小有名气)

同问。
但您这些基因应该有某种相似性,才可以检索到。
4楼2014-07-02 15:56:09
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进化生物学

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

5楼2018-06-15 06:58:54
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