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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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从现在做起

铁虫 (小有名气)

[求助] auto dock 计算时有包括配位键吗?急

我的蛋白中有金属离子,可以与配体中的氧形成配位键,根据晶体结构坐标使配体在蛋白中处于合适的位置,但是auto dock 计算时,算出来的配体构象偏离原来位置很远,相互作用方式中也没有形成晶体中出现的配位键,与金属离子作用的氧也不是晶体中的那个氧原子。所以请教一下,auto dock软件中把配位键列入其作用方式里面了吗?还是因为我的配体处理的不好,或grid,dock参数不合适导致作用方式不理想?应该怎么改呢?
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bolix

铁虫 (正式写手)

我想知道
2楼2014-07-18 10:03:12
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