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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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我芹菜

铜虫 (小有名气)


[交流] 【求助】已搜索,无:如何使用VMD使配体和受体合并

软件:VMD
对象:复合物一,蛋白质二,(复合物一中蛋白质和蛋白质二属于二聚体中的两个部分)
目标:复合物一的受体复制到蛋白质二的腔中
据说VMD可以达到以上的目的,请教各位知道的大虾,进行指导,谢谢。。。
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wally8962

木虫 (著名写手)


你是要做图?进行结构分析?
还是要生成可供计算的结构?
2楼2010-12-08 16:12:19
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arthurii

木虫 (正式写手)


★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-12-09 17:41:24
不是很明白你要干嘛,直接用VMD打开,两个都开了,假如位置就是对的,你直接拿记事本,把两个文件的内容放在一起就行了……
3楼2010-12-09 00:20:58
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我芹菜

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by wally8962 at 2010-12-08 16:12:19:
你是要做图?进行结构分析?
还是要生成可供计算的结构?

我要生成可以进行动力学的结构
4楼2010-12-10 08:58:19
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我芹菜

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by arthurii at 2010-12-09 00:20:58:
不是很明白你要干嘛,直接用VMD打开,两个都开了,假如位置就是对的,你直接拿记事本,把两个文件的内容放在一起就行了……

两个可以都打开,但是位置不对,不知道可不可以达到我想要的复合结构。。。
5楼2010-12-10 08:59:21
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wally8962

木虫 (著名写手)



ghcacj(金币+1):谢谢 2010-12-10 10:38:09
我芹菜(金币+1): 2010-12-12 09:53:13
做动力学的话就按你做动力学的软件的法子来。
6楼2010-12-10 09:55:42
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wally8962

木虫 (著名写手)


★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-12-10 12:21:41
我芹菜(金币+1): 2010-12-12 09:53:10
引用回帖:
Originally posted by 我芹菜 at 2010-12-10 08:59:21:

两个可以都打开,但是位置不对,不知道可不可以达到我想要的复合结构。。。

如果是要在vmd里面移动一个对象,有很多方法。

最简单的,移动一个分子,键盘快捷键,按数字“6”,然后用鼠标拖动分子,即可平移
7楼2010-12-10 11:16:58
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