应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】已搜索，无：如何使用VMD使配体和受体合并
71/1返回列表
查看: 2008  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

我芹菜

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】已搜索，无：如何使用VMD使配体和受体合并

软件：VMD
对象：复合物一，蛋白质二，（复合物一中蛋白质和蛋白质二属于二聚体中的两个部分）
目标：复合物一的受体复制到蛋白质二的腔中
据说VMD可以达到以上的目的，请教各位知道的大虾，进行指导，谢谢。。。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2010-12-08 09:21:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wally8962

木虫 (著名写手)
你是要做图？进行结构分析？
还是要生成可供计算的结构？
赞一下 回复此楼
2楼2010-12-08 16:12:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

arthurii

木虫 (正式写手)
★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-12-09 17:41:24
不是很明白你要干嘛，直接用VMD打开，两个都开了，假如位置就是对的，你直接拿记事本，把两个文件的内容放在一起就行了……
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-12-09 00:20:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我芹菜

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by wally8962 at 2010-12-08 16:12:19:
你是要做图？进行结构分析？
还是要生成可供计算的结构？

我要生成可以进行动力学的结构
赞一下 回复此楼
4楼2010-12-10 08:58:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我芹菜

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by arthurii at 2010-12-09 00:20:58:
不是很明白你要干嘛，直接用VMD打开，两个都开了，假如位置就是对的，你直接拿记事本，把两个文件的内容放在一起就行了……

两个可以都打开，但是位置不对，不知道可不可以达到我想要的复合结构。。。
赞一下 回复此楼
5楼2010-12-10 08:59:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wally8962

木虫 (著名写手)
★
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-12-10 10:38:09
我芹菜(金币+1): 2010-12-12 09:53:13
做动力学的话就按你做动力学的软件的法子来。
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2010-12-10 09:55:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wally8962

木虫 (著名写手)
★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-12-10 12:21:41
我芹菜(金币+1): 2010-12-12 09:53:10
引用回帖:
Originally posted by 我芹菜 at 2010-12-10 08:59:21:

两个可以都打开，但是位置不对，不知道可不可以达到我想要的复合结构。。。

如果是要在vmd里面移动一个对象，有很多方法。

最简单的，移动一个分子，键盘快捷键，按数字“6”，然后用鼠标拖动分子，即可平移
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2010-12-10 11:16:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 我芹菜 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上提前没消息，有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 17/850 2026-08-04 09:46 by archvillain
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 f1dmPx051StA 2026-08-03 7/350 2026-08-04 09:31 by v1TJC4qJauAB
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 jRl3mE6ddZGq 2026-08-03 10/500 2026-08-04 09:26 by v1TJC4qJauAB
[博后之家] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 9/450 2026-08-04 09:17 by v1TJC4qJauAB
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 10/500 2026-08-04 09:15 by v1TJC4qJauAB
[基金申请] 系统今天又提示维护了，估计离放榜不远了 +12 winnerche 2026-07-29 16/800 2026-08-04 08:18 by Equinoxhua
[有机交流] 一个有机合成实验室都需要哪些设备？ 50+3 kf2781974 2026-07-31 10/500 2026-08-04 08:05 by 88817753
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 9/450 2026-08-04 07:37 by k7OM8YghWbkC
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 13/650 2026-08-04 07:30 by k7OM8YghWbkC
[教师之家] 基础研究怎么拉横向，学校到款任务越来越多，难以完成 拉横向，都有哪些途径啊 +9 锦衣卫寒战 2026-07-28 13/650 2026-08-04 07:21 by Ermito
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 6/300 2026-08-04 06:10 by k7OM8YghWbkC
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 7/350 2026-08-04 04:46 by k7OM8YghWbkC
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 8/400 2026-08-04 03:21 by k7OM8YghWbkC
[基金申请] 什么时候能放榜呀？ +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
[基金申请] 面上再次挂了，太难了，躺也躺不了，倦也卷不过，小学校之殇！ +19 低垂的野花 2026-07-31 25/1250 2026-08-03 09:25 by gy116024
[基金申请] 2026年国自然面上资助率 +16 布布和一二 2026-07-30 22/1100 2026-08-03 09:20 by gy116024
[基金申请] 微信指数没变化，科研之友没阅读 +15 wangze12014 2026-07-28 19/950 2026-08-02 20:05 by 蔡棒棒菂
[考博] 2027年申博 50+3 射雕英雄胜 2026-07-30 3/150 2026-08-02 09:36 by lfy8008
[高分子] HXDI做水性聚氨酯乳液，是不是特别容易出渣 15+3 yuyusuv 2026-07-29 3/150 2026-07-31 09:21 by huizingga
[基金申请] 你们的时间戳变了吗 +3 archvillain 2026-07-30 4/200 2026-07-30 18:53 by levinzhwen
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭