应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】已搜索，无：如何使用VMD使配体和受体合并
71/1返回列表
查看: 2046  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

我芹菜

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】已搜索，无：如何使用VMD使配体和受体合并

软件：VMD
对象：复合物一，蛋白质二，（复合物一中蛋白质和蛋白质二属于二聚体中的两个部分）
目标：复合物一的受体复制到蛋白质二的腔中
据说VMD可以达到以上的目的，请教各位知道的大虾，进行指导，谢谢。。。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2010-12-08 09:21:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wally8962

木虫 (著名写手)
你是要做图？进行结构分析？
还是要生成可供计算的结构？
赞一下 回复此楼
2楼2010-12-08 16:12:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

arthurii

木虫 (正式写手)
★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-12-09 17:41:24
不是很明白你要干嘛，直接用VMD打开，两个都开了，假如位置就是对的，你直接拿记事本，把两个文件的内容放在一起就行了……
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-12-09 00:20:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我芹菜

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by wally8962 at 2010-12-08 16:12:19:
你是要做图？进行结构分析？
还是要生成可供计算的结构？

我要生成可以进行动力学的结构
赞一下 回复此楼
4楼2010-12-10 08:58:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我芹菜

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by arthurii at 2010-12-09 00:20:58:
不是很明白你要干嘛，直接用VMD打开，两个都开了，假如位置就是对的，你直接拿记事本，把两个文件的内容放在一起就行了……

两个可以都打开，但是位置不对，不知道可不可以达到我想要的复合结构。。。
赞一下 回复此楼
5楼2010-12-10 08:59:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wally8962

木虫 (著名写手)
★
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-12-10 10:38:09
我芹菜(金币+1): 2010-12-12 09:53:13
做动力学的话就按你做动力学的软件的法子来。
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2010-12-10 09:55:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wally8962

木虫 (著名写手)
★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-12-10 12:21:41
我芹菜(金币+1): 2010-12-12 09:53:10
引用回帖:
Originally posted by 我芹菜 at 2010-12-10 08:59:21:

两个可以都打开，但是位置不对，不知道可不可以达到我想要的复合结构。。。

如果是要在vmd里面移动一个对象，有很多方法。

最简单的，移动一个分子，键盘快捷键，按数字“6”，然后用鼠标拖动分子，即可平移
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2010-12-10 11:16:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 我芹菜 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 18/900 2026-08-25 14:50 by Weed114114
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 +4 ziyangfang 2026-08-25 4/200 2026-08-25 14:41 by ZJTJZ
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +6 yuleib84 2026-08-25 7/350 2026-08-25 14:40 by 六两废铜
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +7 炎黄贵胄 2026-08-22 8/400 2026-08-25 08:48 by ZJTJZ
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +25 yaoyewhu2008 2026-08-20 27/1350 2026-08-25 08:01 by Equinoxhua
[基金申请] 明天应该可查了！？ +5 chengyan1220 2026-08-23 5/250 2026-08-24 23:28 by 我4大白菜
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤？
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 21/1050 2026-08-24 14:21 by refreshing11
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗？ +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭