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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 核酸提取 » 提取细菌基因组DNA
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xiaomeng12

银虫 (正式写手)

[求助] 提取细菌基因组DNA 已有1人参与

今天提取细菌基因组DNA，提了5份，请大家帮忙看看结果，谢谢！5-3-7：浓度：91.9084ng/uL        ，A260/A280:1.6132,
5-3-8.浓度90.7097ng/uL，A260/A280:1.7876    .5-3-9浓度：89.3777ng/uL，A260/A280:1.7424

提取细菌基因组DNA
5-3-7.jpg


提取细菌基因组DNA-1
5-3-8.jpg


提取细菌基因组DNA-2
5-3-9.jpg
请问提取的这三个纯不纯啊？
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1楼 2014-05-30 22:23:20
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liuchi0426

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-05-31 03:41:47
xiaomeng12: 金币+2, ★有帮助, 谢谢 2014-05-31 10:43:20
xiaomeng12: 金币+8, ★有帮助, 再加点金币，谢谢 2014-06-02 22:13:25
提基因组纯不纯要看后面做什么的，比如对于测序来说重要的还有260/230，看你的样基本算可以了，后面pcr什么的应该不会有问题
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Iamthebest!
2楼2014-05-30 22:46:49
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luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xiaomeng12(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-06-01 13:03:01
xiaomeng12: 金币+10, ★有帮助, 谢谢 2014-06-01 13:21:52
试剂盒提的吧？浓度挺低的。纯的DNA A260/A280为1.8  RNA为2.0  低于这个值说明体系中存在没有去除干净的蛋白。当这个值高于2.2说明核酸已经发生降解了。
此外 A260/A230是用来表征糖类、盐类、有机试剂的参数，比较纯的DNA这个值在2.0——2.5之间，如果低于这个值说明提取过程中，苯酚、乙醇或者体系中多糖没有除净，也会影响后续实验
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大家相互帮助哈
8楼2014-06-01 00:40:39
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luwei13566

木虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by xiaomeng12 at 2014-06-01 13:44:15
后面就是以这个为模板进行PCR,影响很大吗？...

A260/A280还好，A260/A230只要别太低，比如低于1.3就没啥问题。基因组做PCR的模板的要求最低。
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xiaomeng12
大家相互帮助哈
11楼2014-06-01 20:58:48
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普通回帖

xiaomeng12

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuchi0426 at 2014-05-30 22:46:49
提基因组纯不纯要看后面做什么的，比如对于测序来说重要的还有260/230，看你的样基本算可以了，后面pcr什么的应该不会有问题

260/230需要在什么范围呢？
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3楼2014-05-30 22:53:37
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xiaomeng12

银虫 (正式写手)
以下图：浓度78.2992        ng/uL        A260/A280 ：2.4824
是有RNA污染吗？
提取细菌基因组DNA-3
5-3-6.jpg
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4楼2014-05-30 22:56:49
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xiaomeng12

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuchi0426 at 2014-05-30 22:46:49
提基因组纯不纯要看后面做什么的，比如对于测序来说重要的还有260/230，看你的样基本算可以了，后面pcr什么的应该不会有问题

我后面需要以DNA为模板进行PCR，扩增几个基因。
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5楼2014-05-30 22:58:03
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xiaomeng12

银虫 (正式写手)
谁能帮我看看啊？在线等
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6楼2014-05-31 20:08:28
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xiaomeng12

银虫 (正式写手)
请大家帮我看看吧，谢谢了
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7楼2014-05-31 20:38:52
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xiaomeng12

银虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-06-01 00:40:39
试剂盒提的吧？浓度挺低的。纯的DNA A260/A280为1.8  RNA为2.0  低于这个值说明体系中存在没有去除干净的蛋白。当这个值高于2.2说明核酸已经发生降解了。
此外 A260/A230是用来表征糖类、盐类、有机试剂的参数，比 ...

谢谢！提的几个不是 A260/A280不在1.8左右，就是A260/A230不在2.0——2.5之间，我是按照要求提的，不知道哪里出错了？
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9楼2014-06-01 13:27:02
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xiaomeng12

银虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-06-01 00:40:39
试剂盒提的吧？浓度挺低的。纯的DNA A260/A280为1.8  RNA为2.0  低于这个值说明体系中存在没有去除干净的蛋白。当这个值高于2.2说明核酸已经发生降解了。
此外 A260/A230是用来表征糖类、盐类、有机试剂的参数，比 ...

后面就是以这个为模板进行PCR,影响很大吗？
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10楼2014-06-01 13:44:15
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