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wardwaads

银虫 (小有名气)

[求助] 琼脂糖凝胶电泳:同一批样每次结果不一致,为什么?_? 已有2人参与

请大家帮我分析一下下面这三张图:
这三张图都是同一批PCR产物的,目的条带大小为400多bp,其中 图4.21 是pcr结束后立即跑的;图new1 图new2 分别是隔夜后第2,3次跑的。

我自己有以下几个疑惑:
1.图4.21 中为什么目的条带是月牙形的?胶上背景不均我认为可能和没有冲洗彻底有关,或者是制胶问题?
2.图new1 同一批样品为什么完全没有显示条带?marker是有的。
3.图new2 再次跑了之后发现又有了条带,但是参差不齐,而且大部分目的条带不在400bp了,不知道是为什么?
4.另外空白样中出现了目的条带,我不认为我操作中出现了交叉污染。可能是什么原因导致呢?


另外需要说明的是,我的这些条带是通过两步法PCR做出的。即:第一次PCR后取产物加入新的体系中进行第二次PCR,然后来跑胶。因为第一次PCR产物跑胶一直跑不出来,所以我认为是由于我的模板含量在我的样本中的含量过低。

请大家帮我分析分析,谢谢~

琼脂糖凝胶电泳:同一批样每次结果不一致,为什么?_?
new1.jpg


琼脂糖凝胶电泳:同一批样每次结果不一致,为什么?_?-1
new2.jpg


琼脂糖凝胶电泳:同一批样每次结果不一致,为什么?_?-2
4.21.jpg
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笑西少

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

对于月牙形状的条带,我感觉应该是胶孔的问题,拔梳子的时候很可能会产生胶孔不均匀。我的经验是,在拔梳子前,把一部分电解液冲到胶孔上。因为梳子是疏水材料做的,所以加上电解液,会比较容易拔出来梳子,胶孔形状也比较好。对于图new1和new2,我还真的没有遇到过类似情况。愿LZ实验顺利!

P.S.我也是刚刚开始PCR和跑胶的,经验多有不足,如果表达有误,见谅见谅。
天然产物化学
8楼2014-06-12 19:14:18
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yuren2009

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
确定后目的条带位置?你的Marker没标错吧最低多少?
学习使你立于不败之地
2楼2014-04-24 10:44:00
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wardwaads

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yuren2009 at 2014-04-24 10:44:00
确定后目的条带位置?你的Marker没标错吧最低多少?

DL500,分别是:500,400,300,200,150,100,50
3楼2014-04-25 09:49:20
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jonew

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
月牙形说明你胶浓度小   另外小孔胶有时候就这样
借口很贱,,,
4楼2014-04-25 10:20:52
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