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3‘RACE序列比对了居然是26S核糖体RNA基因 这是怎么回事 求指点 !!!!!万分感谢已有4人参与
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应用CloneTech Smart RACE试剂盒做3’RACE 应用试剂盒的UPM引物基因特异性引物 退火58度 延伸2min 得到了750bp 和300bp 的条带 测序 结果都是26S核糖体RNA基因 ,不是我要的基因序列 请问我到底哪里出了错? |
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karin
木虫 (小有名气)
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【答案】应助回帖
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yoyo单眼皮: 金币+8, ★★★很有帮助 2014-04-24 21:30:25
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我最近也在用CloneTech Smart RACE试剂盒做5’RACE ,换了若干引物,用的touch-down PCR,测了若干2kb、1kb、750bp、500bp条带,都是核糖体28s,18s,5.8s基因簇里的片段。后来我拿自己的基因和这个基因簇对比了一下,确实有相似度高的部分,后来就选择相似度低的部分设计特异引物,目前正在做,反正不再出以前那些明显不对的条带了。 你可以也比对一下,是不是和我的情况类似呢,还有就是设计特引物的时候选择Tm值高的,以便做touch-down PCR。当参考吧,祝你早日成功! ![]() |

5楼2014-04-24 11:11:33
biostar2009
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【答案】应助回帖
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仔细分析你得到的序列,你找到了非模板A么? 看看这个: http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7194592 |
2楼2014-04-23 16:01:45
Neo2000
木虫 (著名写手)
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