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水儿CoCo

木虫 (小有名气)

[求助] gromacs运行nvt时出错

grompp -f nvt.mdp -c mcl4-em.gro -p mcl4.top -n sindex.ndx -o mcl4-nvt.tpr我在运行这步之后进行nvt
可是没有运行多久它就停了
生出文件
然后我打开了gromacs-nvt.log和 mcl4-nvt.log，里面显示为这样的
怎么会生出那么多的一步一步的pdb文件呢？我之前做到这步的时候还生成了一千步然后就停止了，这次是几十步就停止了，
求大神指点

gromacs运行nvt时出错
输出文件.jpg


gromacs运行nvt时出错-1
mcl4-nvt.jpg


gromacs运行nvt时出错-2
gromacs-nvt.jpg
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1楼 2014-04-21 10:27:18
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罗艺青

新虫 (初入文坛)
你好，你的问题解决了吗？？我也遇到同样问题，不知道怎么解决
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2楼2018-08-21 22:12:24
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