| 查看: 2207 | 回复: 6 | |||
mengyan142木虫 (小有名气)
|
[求助]
AMBER11+AmberTool1.5安装出错（ 显卡型号GTX680）
|
|
显卡GTX680, 系统CentOS6.2 ,显卡驱动NVIDIA-Linux-x86_64-295.49.run，CUDA Toolkit 4.0， 编译器l_fcompxe_2011.9.293、 l_ccompxe_2011.9.293 在安装CUDA加速的PMEMD这步，测试的时候提示：cudaMemcpyToSymbol: SetSim copy to cSim failed invalid device symbol 详细提示如下： ./test_amber_cuda.sh Using default GPU_ID = -1 Using default PREC_MODEL = SPDP Warning. DO_PARALLEL is set to mpirun -np 4. This environment variable is being unset. cd cuda && make -k test.pmemd.cuda GPU_ID=-1 PREC_MODEL=SPDP make[1]: Entering directory `/home/xmpu211/amber11/test/cuda' ------------------------------------ Running CUDA Implicit solvent tests. Precision Model = SPDP GPU_ID = -1 ------------------------------------ cd trpcage/ && ./Run_md_trpcage -1 SPDP netcdf.mod cudaMemcpyToSymbol: SetSim copy to cSim failed invalid device symbol ./Run_md_trpcage: Program error make[1]: *** [test.pmemd.cuda.gb] Error 1 cd gb_ala3/ && ./Run.igb1_ntc1_min -1 SPDP netcdf.mod cudaMemcpyToSymbol: SetSim copy to cSim failed invalid device symbol ./Run.igb1_ntc1_min: Program error make[1]: *** [test.pmemd.cuda.gb.serial] Error 1 ------------------------------------ Running CUDA Explicit solvent tests. Precision Model = SPDP GPU_ID = -1 ------------------------------------ cd 4096wat/ && ./Run.pure_wat -1 SPDP netcdf.mod cudaMemcpyToSymbol: SetSim copy to cSim failed invalid device symbol ./Run.pure_wat: Program error make[1]: *** [test.pmemd.cuda.pme] Error 1 make[1]: Target `test.pmemd.cuda' not remade because of errors. make[1]: Leaving directory `/home/xmpu211/amber11/test/cuda' make: *** [test.pmemd.cuda] Error 2 make: Target `test.serial.cuda' not remade because of errors. 0 file comparisons passed 0 file comparisons failed 9 tests experienced errors Test log file saved as logs/test_amber_cuda/2012-05-09_08-55-32.log No test diffs to save!  结果图 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 amber |
» 猜你喜欢
寻求一种能扛住强氧化性腐蚀性的容器密封件
已经有7人回复
-
到新单位后，换了新的研究方向，没有团队，持续积累2区以上论文，能申请到面上吗
已经有8人回复
-
申请2026年博士
已经有6人回复
-
请问哪里可以有青B申请的本子可以借鉴一下。
已经有5人回复
-
天津工业大学郑柳春团队欢迎化学化工、高分子化学或有机合成方向的博士生和硕士生加入
已经有5人回复
-
2025冷门绝学什么时候出结果
已经有7人回复
-
请问有评职称，把科研教学业绩算分排序的高校吗
已经有6人回复
-
Bioresource Technology期刊，第一次返修的时候被退回好几次了
已经有7人回复
-
请问下大家为什么这个铃木偶联几乎不反应呢
已经有5人回复
-
康复大学泰山学者周祺惠团队招收博士研究生
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
高斯安装成功，运行提示出错。
已经有10人回复- 安装 TECPLOT 360时出错 请各位高手指点
已经有6人回复
- cygwin系统之下安装abinite不知什么原因出错了？
已经有6人回复
- abinit-6.8.2安装出错，求解决方法。
已经有3人回复
- MS5.0安装出错，显示“Fail to create a ParallelManager object”。郁闷！
已经有7人回复
- 安装Materials Studio 5.5 for Windows出错
已经有10人回复
- MS起初运行时就出错，而且不管运行什么都是，会不会是安装的问题啊？
已经有6人回复
- 【求助】abinit -6.6.1 安装出错
已经有7人回复
- 【求助】这是我安装gromacs过程，但是出错阿，这个怎么办呢？谢谢
已经有11人回复
- 【求助】abinit-6.4.1安装出错，求助原因
已经有4人回复
- 【求助】大家看看，matlab安装过程的截图，找出错
已经有14人回复
- 【求助完毕】Abinit 6.2.3安装出错
已经有7人回复
- 【求助】mkl+ifort+openmpi+siesta3.并行安装出错
已经有8人回复
- 【求助】MPI2-1.0.8安装出错求助
已经有5人回复
- 【求助】MS4.4在REDHAT5.0集群上安装出错，附步骤，望高手指正
已经有16人回复
 顶一下 |
2楼2012-05-10 09:36:19
3楼2012-05-10 11:32:42
mengyan142
木虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 823.6
- 散金: 86
- 红花: 2
- 帖子: 110
- 在线: 52.4小时
- 虫号: 1089783
- 注册: 2010-09-05
- 性别: MM
- 专业: 粉末冶金与粉体工程
4楼2012-05-11 09:48:57
5楼2012-05-13 16:15:45
Ling198980
金虫 (正式写手)
- 应助: 14 (小学生)
- 金币: 733.6
- 红花: 1
- 帖子: 794
- 在线: 19.1小时
- 虫号: 1783716
- 注册: 2012-04-28
- 性别: MM
- 专业: 中药制剂
6楼2012-05-13 16:24:20
sosako
金虫 (著名写手)
- 应助: 86 (初中生)
- 金币: 1016.2
- 红花: 3
- 帖子: 1133
- 在线: 43.4小时
- 虫号: 855904
- 注册: 2009-09-24
- 性别: GG
- 专业: 药剂学
7楼2012-05-13 16:28:30