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mengyan142木虫 (小有名气)
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AMBER11+AmberTool1.5安装出错（ 显卡型号GTX680）
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显卡GTX680, 系统CentOS6.2 ,显卡驱动NVIDIA-Linux-x86_64-295.49.run，CUDA Toolkit 4.0， 编译器l_fcompxe_2011.9.293、 l_ccompxe_2011.9.293 在安装CUDA加速的PMEMD这步，测试的时候提示：cudaMemcpyToSymbol: SetSim copy to cSim failed invalid device symbol 详细提示如下： ./test_amber_cuda.sh Using default GPU_ID = -1 Using default PREC_MODEL = SPDP Warning. DO_PARALLEL is set to mpirun -np 4. This environment variable is being unset. cd cuda && make -k test.pmemd.cuda GPU_ID=-1 PREC_MODEL=SPDP make[1]: Entering directory `/home/xmpu211/amber11/test/cuda' ------------------------------------ Running CUDA Implicit solvent tests. Precision Model = SPDP GPU_ID = -1 ------------------------------------ cd trpcage/ && ./Run_md_trpcage -1 SPDP netcdf.mod cudaMemcpyToSymbol: SetSim copy to cSim failed invalid device symbol ./Run_md_trpcage: Program error make[1]: *** [test.pmemd.cuda.gb] Error 1 cd gb_ala3/ && ./Run.igb1_ntc1_min -1 SPDP netcdf.mod cudaMemcpyToSymbol: SetSim copy to cSim failed invalid device symbol ./Run.igb1_ntc1_min: Program error make[1]: *** [test.pmemd.cuda.gb.serial] Error 1 ------------------------------------ Running CUDA Explicit solvent tests. Precision Model = SPDP GPU_ID = -1 ------------------------------------ cd 4096wat/ && ./Run.pure_wat -1 SPDP netcdf.mod cudaMemcpyToSymbol: SetSim copy to cSim failed invalid device symbol ./Run.pure_wat: Program error make[1]: *** [test.pmemd.cuda.pme] Error 1 make[1]: Target `test.pmemd.cuda' not remade because of errors. make[1]: Leaving directory `/home/xmpu211/amber11/test/cuda' make: *** [test.pmemd.cuda] Error 2 make: Target `test.serial.cuda' not remade because of errors. 0 file comparisons passed 0 file comparisons failed 9 tests experienced errors Test log file saved as logs/test_amber_cuda/2012-05-09_08-55-32.log No test diffs to save!  结果图 |
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mengyan142
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