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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 如何确定一个蛋白是否具有蛋白水解功能域？
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zzx219

木虫 (小有名气)

[求助] 如何确定一个蛋白是否具有蛋白水解功能域？ 已有2人参与

最近做一个病毒蛋白，发现其能裂解宿主蛋白，那么如何证明其具有蛋白水解酶的功能呢？蛋白水解酶是不是都有保守的氨基酸序列？或者有蛋白水解酶核心，从氨基酸水平分析能不能确定其是否具有水解酶功能呢？请高人指点，谢谢！
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zzxwalkzone
1楼 2014-04-14 09:41:54
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polypro

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
zzx219(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-04-14 10:23:09
水解酶一般具有特异性，可以对宿主蛋白水解前后跑SDS-PAGE，病毒蛋白的特异水解位置可以用MS进行确定
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泉涸,鱼相与处于陆,相呴以湿,相濡以沫,不如相忘于江湖。
2楼2014-04-14 09:57:50
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zzx219: 金币+9, ★★★很有帮助 2014-04-18 10:38:21
拿到蛋白质序列可以先用SMART做一下蛋白质功能结构域预测分析。
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3楼2014-04-14 11:32:39
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