| 查看: 5964 | 回复: 7 | ||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||
lwk5716铁杆木虫 (正式写手)
|
[求助]
如何确定一段序列中那一部分是启动子 已有3人参与
|
|||
各位前辈大家好：我先一个问题感到不解，我通过抑制差减杂交获得了一段基因的序列，并且在网上和其同源序列比对，发现开放阅读框是拿到了，3'末端到了polyA，5'末端到了ATG之前的几个碱基。我用那这段序列和数据库比对找到了对应了DNA序列，并且有了ATG前面的6Kb多的序列，但我不知道启动子具体是哪部分，转录起始点是哪里？请问各位前辈有没有什么软件或者网站可以预测啊？或者有没有什么分子生物学手段进行研究，我想知道它受哪类转录因子调控。谢谢各位前辈了。 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 表观遗传 |
» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有197人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 如何获得一个基因的启动子序列
已经有6人回复
- 怎样获取一个基因的CDS序列
已经有13人回复
- 请问如何在genebank中检索玉米基因的启动子序列啊？
已经有3人回复
- 怎么缺失一段完整的基因？？
已经有6人回复
- 请教做过基因染色体整合的大侠们
已经有9人回复
- 如何查找基因保守序列
已经有6人回复
- 多克隆酶切位点可以任意插入基因吗？不用考虑启动子的距离吗？
已经有8人回复
- 如何用NCBI查找一段基因序列的启动子？
已经有11人回复
- 蛋白表达的序列为什么比基因序列短
已经有6人回复
- 在NCBI里搜索到a基因多条序列，如何确定该基因的序列？
已经有9人回复
- 如何查找一段基因序列的启动子？
已经有3人回复
- 只知道基因CDS区序列，如何扩增该基因的启动子
已经有11人回复
- 关于克隆植物基因启动子序列？
已经有4人回复
- 如何找到水稻一段序列的上下游序列？
已经有5人回复
- 已知一段启动子序列，如何查找它可能在哪些基因中起作用
已经有4人回复
- 利用NCBI,查询乳酸乳球菌的乳糖操纵子中的Lac A 基因启动子序列
已经有8人回复
- 关于基因构建中开放阅读框架的若干问题
已经有7人回复
- 怎么判断目的基因序列中是否含有信号肽~~
已经有11人回复
- GUS基因与启动子序列检测
已经有5人回复
- 重大问题，有谁知道pMD18-t等Amp+抗性载体中AmpR的启动子序列是什么？
已经有3人回复
- 【求助】tac启动子序列
已经有9人回复
- 【求助/交流】小弟对启动子序列的确定有惑，望解惑。
已经有17人回复
- 【求助/交流】怎么查找已知名字的启动子序列？
已经有6人回复
- 启动子序列分析软件
已经有2人回复
lwk5716
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 7 (幼儿园)
- 金币: 6993.4
- 散金: 181
- 红花: 3
- 帖子: 412
- 在线: 92.7小时
- 虫号: 2628224
- 注册: 2013-09-01
- 性别: GG
- 专业: 作物分子育种
5楼2014-04-02 09:54:26
biostar2009
专家顾问 (正式写手)
-
专家经验: +220 - MolEPI: 20
- 应助: 231 (大学生)
- 金币: 10391.9
- 散金: 387
- 红花: 63
- 帖子: 540
- 在线: 151.9小时
- 虫号: 2811882
- 注册: 2013-11-19
- 专业: 生物化学
- 管辖: 分子生物
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lwk5716(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-04-02 08:31:39
lwk5716: 金币+2, ★★★★★最佳答案 2014-04-02 10:06:26
感谢参与，应助指数 +1
lwk5716(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-04-02 08:31:39
lwk5716: 金币+2, ★★★★★最佳答案 2014-04-02 10:06:26
|
你这个是经典的启动子mapping实验 很简单，你可以搞一个报告基因系统，Luciferase、CAT、甚至来个GFP也行。 然后找一个没有启动子的表达载体，Luciferase系统的就是pGL3-Basic应该 再把你怀疑有启动子活性的片段装进去 检测下游报告基因是否表达 用这个系统，你可以通过不断的做deletion，找到你这段长序列里面的核心启动子 看看《分子克隆》第三版，有这些内容很详细的说明 |
2楼2014-04-01 20:30:22
★
感谢参与，应助指数 +1
lwk5716(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-04-02 08:31:54
感谢参与，应助指数 +1
lwk5716(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-04-02 08:31:54
|
本帖内容被屏蔽 |
3楼2014-04-01 23:55:30
lvbobo823
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 363 (硕士)
- 金币: 7753.3
- 散金: 15
- 红花: 9
- 帖子: 751
- 在线: 189.4小时
- 虫号: 819723
- 注册: 2009-07-31
- 性别: GG
- 专业: 植物遗传学
4楼2014-04-02 07:28:02
20