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克隆文库构建
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2012xin
新虫
(初入文坛)
应助: 1
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虫号: 1603680
注册: 2012-02-07
性别: GG
专业: 环境微生物学
[
求助
]
克隆文库构建
已有2人参与
求助,哪位高手指点一下,如何将克隆测好的200条序列划分OTU,通过什么软件,最好详细点,谢过!
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1楼
2014-04-01 10:10:56
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dakongy1987
铜虫
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在线: 34.2小时
虫号: 893020
注册: 2009-11-04
专业: 全球变化生态学
【答案】应助回帖
能不能给我发一个mothur软件?我下载不了这个软件在官网上
zwp007007007@126.com
非常感谢,最近刚做完克隆的数据,不知道怎么分析OTU。
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4楼
2016-05-02 21:20:16
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zrg1989
铜虫
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注册: 2009-12-06
性别: GG
专业: 环境微生物学
【答案】应助回帖
★ ★
感谢参与,应助指数 +1
2012xin(dllchina代发): 金币+2, 多多交流
2014-04-01 19:52:51
用mothur
http://www.mothur.org/wiki/Mothur_manual
命令align.seqs -- dist.seqs -- cluster聚类为OTU
在此之前需要用seqman去掉载体序列
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2楼
2014-04-01 14:37:08
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琪瑶儿
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虫号: 1049495
注册: 2010-06-29
专业: 环境微生物学
我是来学习的。马上要开始用了
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海洋环境微生物《DGGE,海洋污染修复
3楼
2014-04-02 15:11:52
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二月smile
新虫
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虫号: 3754835
注册: 2015-03-21
性别:
MM
专业: 环境微生物学
楼主,你会了吗?我现在也遇到了这个问题,能不能教教我。
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5楼
2016-10-15 19:57:25
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