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2012xin

新虫 (初入文坛)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 375.6
帖子: 10
在线: 71.4小时
虫号: 1603680
注册: 2012-02-07
性别: GG
专业: 环境微生物学

[求助] 克隆文库构建已有2人参与

求助，哪位高手指点一下，如何将克隆测好的200条序列划分OTU,通过什么软件，最好详细点，谢过！

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1楼 2014-04-01 10:10:56

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

zrg1989

铜虫 (小有名气)

应助: 10 (幼儿园)
金币: 222.5
红花: 1
帖子: 123
在线: 78.6小时
虫号: 921561
注册: 2009-12-06
性别: GG
专业: 环境微生物学

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
2012xin(dllchina代发): 金币+2, 多多交流 2014-04-01 19:52:51

用mothur http://www.mothur.org/wiki/Mothur_manual
命令align.seqs -- dist.seqs -- cluster聚类为OTU
在此之前需要用seqman去掉载体序列

赞一下(2人)

2楼2014-04-01 14:37:08

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

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