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2012xin

新虫 (初入文坛)

[求助] 克隆文库构建 已有2人参与

求助,哪位高手指点一下,如何将克隆测好的200条序列划分OTU,通过什么软件,最好详细点,谢过!
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zrg1989

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
2012xin(dllchina代发): 金币+2, 多多交流 2014-04-01 19:52:51
用mothur http://www.mothur.org/wiki/Mothur_manual
命令align.seqs -- dist.seqs -- cluster聚类为OTU
在此之前需要用seqman去掉载体序列
2楼2014-04-01 14:37:08
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琪瑶儿

金虫 (小有名气)

我是来学习的。马上要开始用了
海洋环境微生物《DGGE,海洋污染修复
3楼2014-04-02 15:11:52
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dakongy1987

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

能不能给我发一个mothur软件?我下载不了这个软件在官网上 zwp007007007@126.com 非常感谢,最近刚做完克隆的数据,不知道怎么分析OTU。
4楼2016-05-02 21:20:16
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二月smile

新虫 (初入文坛)

楼主,你会了吗?我现在也遇到了这个问题,能不能教教我。
5楼2016-10-15 19:57:25
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二月smile

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dakongy1987 at 2016-05-02 21:20:16
能不能给我发一个mothur软件?我下载不了这个软件在官网上 zwp007007007@126.com 非常感谢,最近刚做完克隆的数据,不知道怎么分析OTU。

请问。你现在会了吗?我现在也遇到了这种问题
能不能教教我。
6楼2016-10-15 19:58:41
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kshdd

金虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 二月smile at 2016-10-15 19:58:41
请问。你现在会了吗?我现在也遇到了这种问题
能不能教教我。...

你先把你的序列按5~3的顺序排布,之后把邮箱给我,我把师兄给我的资料给你

发自小木虫Android客户端
7楼2016-10-16 08:29:44
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二月smile

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by kshdd at 2016-10-16 08:29:44
你先把你的序列按5~3的顺序排布,之后把邮箱给我,我把师兄给我的资料给你
...

398296195@qq.com

发自小木虫IOS客户端
8楼2016-10-16 14:01:47
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