应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 克隆文库中的操作分类单元和Rarefaction analysis
221/1返回列表
查看: 4957  |  回复: 21
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

蓝慧

木虫 (正式写手)

[交流] 克隆文库中的操作分类单元和Rarefaction analysis

在克隆文库评价中，如何理解操作分类单元（OTU）、库容（Coverage）和Rarefaction analysis，请大家指教！

[ Last edited by 蓝慧 on 2012-5-22 at 23:31 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

土壤真菌

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼2012-05-14 18:48:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖置顶 ( 共有3个 )

蓝慧

木虫 (正式写手)
蓝慧: 回帖置顶 2012-05-15 16:53:25
啊啊。。。好希望有个人能回复下有关的内容啊！
赞一下 回复此楼
10楼2012-05-15 16:53:13
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

蓝慧

木虫 (正式写手)
蓝慧: 回帖置顶 2012-05-19 08:30:58
怎么没有人回答呢，没有人知道吗》
赞一下 回复此楼
14楼2012-05-18 22:28:31
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

红太郎张玉

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
蓝慧: 回帖置顶 2012-12-24 08:34:10
怎么没人回复，好想知道
赞一下 回复此楼
15楼2012-12-23 11:55:43
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

浅草沉钟

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
20楼: Originally posted by xw111202105 at 2014-04-23 16:51:37
计算公式：C=×100，其中n1表示OTUs个数，N表示文库中总的克隆数目...

有什么书可以推荐吗？
赞一下(1人) 回复此楼
21楼2014-07-18 17:22:16
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

蓝慧

木虫 (正式写手)
没有人知道吗？
回复此楼
2楼2012-05-15 08:39:30
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuanyeguhong

至尊木虫 (文坛精英)
★
蓝慧(金币+1): 谢谢参与
顶贴！
回复此楼
3楼2012-05-15 08:48:01
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

捡金小儿

新虫 (著名写手)
★
蓝慧(金币+1): 谢谢参与
楼主好运！
回复此楼
6楼2012-05-15 08:57:23
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

拾金昧者

木虫 (著名写手)
★
蓝慧(金币+1): 谢谢参与
楼主真好！
回复此楼
7楼2012-05-15 09:01:50
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

吃虫少妇

金虫 (著名写手)
★
蓝慧(金币+1): 谢谢参与
添人气的！
回复此楼
8楼2012-05-15 09:06:10
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

吃虫少妇

金虫 (著名写手)
楼主好运！
回复此楼
9楼2012-05-15 09:10:19
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

uneei

金虫 (小有名气)
帮楼主顶，我也想了解
赞一下 回复此楼
11楼2012-05-15 19:58:12
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhsDONG

银虫 (小有名气)
共求！
回复此楼
12楼2012-05-16 16:47:19
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖仅楼主可见
赞一下
13楼2012-05-16 22:23:23
 已阅   申请MolEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

蓝慧

木虫 (正式写手)
引用回帖:
15楼: Originally posted by 红太郎张玉 at 2012-12-23 12:55:43
怎么没人回复，好想知道

这贴子到现在几个月了，还没有得到解决方案呢，呵呵！我也是很想知道的
赞一下 回复此楼
16楼2012-12-24 08:31:37
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kaykk

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
稀释曲线貌似是看样品量够不够证明可靠性用的，曲线越成直线，说明可靠性高吧，好像。。
赞一下 回复此楼
17楼2013-04-22 21:27:29
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

蓝慧

木虫 (正式写手)
引用回帖:
17楼: Originally posted by kaykk at 2013-04-22 22:27:29
稀释曲线貌似是看样品量够不够证明可靠性用的，曲线越成直线，说明可靠性高吧，好像。。

那个是叫稀释曲线吗？还有那个是直线吗？到底是直线还是曲线，我到现在看到的是曲线，但是也还不明白是怎么来的，也没有搞懂它的意义。
赞一下 回复此楼
18楼2013-04-23 17:59:52
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

瑶婧姿

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
18楼: Originally posted by 蓝慧 at 2013-04-23 17:59:52
那个是叫稀释曲线吗？还有那个是直线吗？到底是直线还是曲线，我到现在看到的是曲线，但是也还不明白是怎么来的，也没有搞懂它的意义。...

请问一下，Coverage怎么算来的呀？现在看文献看得很头疼，求解救~~~~·谢谢！
赞一下 回复此楼
19楼2013-07-13 16:12:33
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xw111202105

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
19楼: Originally posted by 瑶婧姿 at 2013-07-13 16:12:33
请问一下，Coverage怎么算来的呀？现在看文献看得很头疼，求解救~~~~·谢谢！...

计算公式：C=[1-（n1/N）]×100，其中n1表示OTUs个数，N表示文库中总的克隆数目
赞一下 回复此楼
20楼2014-04-23 16:51:37
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

13621005681

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
OTU类似于种，是根据高变区序列比对得出的，一般相似度大于97%或95%的序列称为同一个OTU
Coverage与Rarefaction类似，Rarefaction是以16srDNA序列条带数目为横坐标，OTU数目为纵坐标的一条曲线，斜率逐渐平缓，即随16srDNA序列条带数目增加，OTU数目也增加。但最后OTu数目不再增多，证明你的取样数足够大了。也就是覆盖度Coverage足够大。证明取样充分，可以进行后续试验~
赞一下 回复此楼
22楼2015-11-11 15:30:59
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
8673929494楼
2012-05-15 08:49   回复  
蓝慧(金币+1): 谢谢参与
啄虫鸟5楼
2012-05-15 08:52   回复  
蓝慧(金币+1): 谢谢参与
相关版块跳转 我要订阅楼主 zenghuilan 的主题更新
221/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复(可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭