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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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蓝慧

木虫 (正式写手)


[交流] 克隆文库中的操作分类单元和Rarefaction analysis

在克隆文库评价中,如何理解操作分类单元(OTU)、库容(Coverage)和Rarefaction analysis,请大家指教!

[ Last edited by 蓝慧 on 2012-5-22 at 23:31 ]
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13621005681

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
OTU类似于种,是根据高变区序列比对得出的,一般相似度大于97%或95%的序列称为同一个OTU
Coverage与Rarefaction类似,Rarefaction是以16srDNA序列条带数目为横坐标,OTU数目为纵坐标的一条曲线,斜率逐渐平缓,即随16srDNA序列条带数目增加,OTU数目也增加。但最后OTu数目不再增多,证明你的取样数足够大了。也就是覆盖度Coverage足够大。证明取样充分,可以进行后续试验~
22楼2015-11-11 15:30:59
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蓝慧

木虫 (正式写手)


没有人知道吗?
2楼2012-05-15 08:39:30
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yuanyeguhong

至尊木虫 (文坛精英)



蓝慧(金币+1): 谢谢参与
顶贴!
3楼2012-05-15 08:48:01
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捡金小儿

新虫 (著名写手)



蓝慧(金币+1): 谢谢参与
楼主好运!
6楼2012-05-15 08:57:23
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