| 查看: 3376 | 回复: 2 | |||||
| 本帖产生 1 个 MolEPI ，点击这里进行查看 | |||||
[求助]
shRNA的构建 已有1人参与
|
|||||
| 请问做RNA干扰设计的shRNA的启动子必须是RNA聚合酶iii类的启动子么？如果是的话，为什么RNA聚合酶ii的不行呢？？ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 分子生化实验经验积累 | 分子生物学技术 |
» 猜你喜欢
拉坦前列腺素(Latanoprost)：前列腺素F2α衍生物如何成为青光眼一线用药
已经有0人回复
-
卟啉家族中的明星分子：MESO-四(3,5-二溴-4-羟基苯基)卟啉的性质与制备
已经有1人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有193人回复
-
宠物寄生虫防治：氟雷拉纳阻断GABA受体，持效12周驱杀跳蚤蜱虫
已经有0人回复
-
为呼吸打开通道：依伐卡托的科学之旅
已经有1人回复
-
Dordaviprone（ONC201）：小分子药物在中线胶质瘤中的应用
已经有0人回复
-
依喜替康：新型喜树碱衍生物的研究进展
已经有1人回复
-
膀胱癌靶向治疗新选择：厄达替尼作用机制与耐药研究进展
已经有0人回复
-
从水母到实验室：腔肠素的发现历程与生物发光奥秘
已经有1人回复
-
线粒体氧化磷酸化的新靶点：S-Gboxin的发现与研究进展
已经有0人回复
-
PROTAC药物开发选择VHL配体：MDK-7526以87%出口向量占有率成首选
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 如何构建纳米晶粒的模型？
已经有4人回复
- 关于肿瘤干细胞转染的问题
已经有4人回复
- 关于RNAi干扰的问题
已经有12人回复
- 质粒构建出了奇怪的现象，实在找不到原因，请大家帮忙看看
已经有10人回复
- 关于载体构建的问题，高手解答一下。
已经有10人回复
- 求助翻译 关于HIF和shRNA
已经有0人回复
- 请问如何构建出图中的结构
已经有7人回复
- 请教shRNA设计问题
已经有4人回复
- 关于构建细胞实验室的细节问题
已经有35人回复
- 菜鸟求助——我系统发育树构建不出来——构建出来的怎么是这样的
已经有15人回复
- 表达载体的构建
已经有17人回复
- ms中的结构构建
已经有3人回复
- 【求助】进化树的构建到底有什么意义呢？
已经有12人回复
- 【求助/交流】关于重组质粒的构建，总是失败，希望高手指点一下啊～～
已经有16人回复
- 【求助/交流】如何构建细菌的基因组表达文库
已经有19人回复
biostar2009
专家顾问 (正式写手)
-
专家经验: +220 - MolEPI: 20
- 应助: 231 (大学生)
- 金币: 10399.9
- 散金: 387
- 红花: 63
- 帖子: 540
- 在线: 151.9小时
- 虫号: 2811882
- 注册: 2013-11-19
- 专业: 生物化学
- 管辖: 分子生物
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+10, MolEPI+1, 非常好！ 2014-03-31 21:43:34
ningning915: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-04-13 21:22:07
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+10, MolEPI+1, 非常好！ 2014-03-31 21:43:34
ningning915: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-04-13 21:22:07
|
哈哈，总算来了一个有意思的问题， 你是怎么想的呢？ polII和polIII的区别，你知道多少呢？ shRNA的作用方式，你又知道多少呢？ 这个必须从shRNA的作用方式说起，所谓RNAi，我们只谈动物中，关键在于siRNA，siRNA由Dicer切割shRNA而来。就这一步，在动植物，高等动物跟低等动物如果蝇线虫之间，就有很大的不同。且不谈。 Dicer切什么样的底物呢？short hairpin-RNA和long double strand RNA，后者多用于果蝇线虫系统。所以哺乳动物细胞中一般都表达shRNA。 作为Dicer最佳底物的shRNA有着结构的要求，其他样子的，切割效率会差。miRNA发现之后已经知道，比shRNA更长的，或者Dicer不能切，但是有hairpin sharp RNA的，被Drosha/DGCR8切。但是很明显，这回极大的降低效率，因为没有哪一步加工会是完全的。 所以，问题的关键回到了如何转录出一个short hairpin RNA 这才到了为什么选择polIII的问题 polIII和polII都有各自的启动子，虽然结构，序列，负责转录的聚合酶不一样，但是也差不多，一般而言+1位也比较固定。 但是区别在于polIII有着明确的终止信号，一般是几个T，5个足够了，你可以发现你设计的shRNA总是以5-6个T结束，这就限定了RNA的大小 但是polII不一样，转录是没有明确的终止这个概念的，所谓的终止就是RNA的polyadenylation，遇见这个信号之后，RNA随后发生切断，加A，但是其实RNA聚合酶还会继续跑一段的。这个不管 问题在于这个加A，这段A首先大小不一，其次一般都比较长，50nt平均肯定有，所以这个会极大的影响shRNA的结构。 所以这些shRNA表达载体，清一色的全是polIII启动子，一般也就用U6和H1 promoter，这两个的结构和起始转录位置研究得很透彻。 |
2楼2014-03-31 20:56:20
3楼2014-03-31 21:59:47
10