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gong_107

金虫 (小有名气)

[求助] 请问如何构建出图中的结构

请问用什么模块或者方式能够如何构建出图中的结构， 这是一个举例，在TiO2金红石（110）表面放入了一个蛋白分子，这个放进去的过程是如何实现的？
TiO2（110）表面构建好了，蛋白分子也构建好了，接下来该如何操作，实在不会，希望高手指导，万分感谢！
请问如何构建出图中的结构
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gong_107

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1楼2013-06-12 18:40:13
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DFPT

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与，应助指数 +1
gong_107: 金币+100, ★有帮助 2013-06-12 22:01:59
假设LZ建立分子和表面两个模型分别在1.xsd和2.xsd中。
1， 打开1.xsd，选中整个分子模型，然后Ctrl+C，或者右键选择复制；
2，打开2.xsd，直接点Ctrl+V，或者右键选择粘贴；
3，不要点其他键的前提下，可以看到拷贝到2.xsd的分子依然是选中状态（全部显示为黄色），使用MS中的移动工具，将其移动到需要的位置（当然，也可做旋转）。
请问如何构建出图中的结构-1
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010-8393-9164
2楼2013-06-12 20:35:21
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gong_107

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by DFPT at 2013-06-12 21:35:21
假设LZ建立分子和表面两个模型分别在1.xsd和2.xsd中。
1， 打开1.xsd，选中整个分子模型，然后Ctrl+C，或者右键选择复制；
2，打开2.xsd，直接点Ctrl+V，或者右键选择粘贴；
3，不要点其他键的前提下，可以看到拷 ...

你好，我也是这样认为的，可是每次粘贴的时候总出现这个对话框而不能粘贴成功，这什么情况？
请问如何构建出图中的结构-2
2.jpg
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3楼2013-06-12 21:33:54
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gong_107

金虫 (小有名气)
刚在google里搜了一下 居然说是有道的原因，它与MS5.5和以上的版本不兼容，我用的是5.5版本，把有道关了重启下MS就可以了，晕倒!
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4楼2013-06-12 22:01:29
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DFPT

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by gong_107 at 2013-06-12 21:33:54
你好，我也是这样认为的，可是每次粘贴的时候总出现这个对话框而不能粘贴成功，这什么情况？

2.jpg
...

LZ没有仔细看我说的话，第一步是选择分子模型再复制粘贴，而不是直接什么都不选择就直接复制粘贴。
详细来说：
下面是建立的两个模型（当然，为了简单，就用了个乙烷代替好了)：
请问如何构建出图中的结构-3
1，选择模型，这是分子模型都显示为黄色：
请问如何构建出图中的结构-4
2，复制小分子到平面模型中，可以看到左下角有复制过去的小分子：
请问如何构建出图中的结构-5
3，把小分子移动到需要的位置：
请问如何构建出图中的结构-6
这里需要讨论一下小分子模型的建模方式问题了
孤立的分子模型，有两种建模方式，一种是就是孤立分子，另一种是在一个大的盒子内的分子。其中第二种模型还是周期模型的，只不过是由于盒子很大，分子之间没有相互作用，近似认为是孤立的。
LZ的问题就出在模型是第二种上。这时，又有两种方法来复制粘贴小分子模型。
方法一，选中分子模型（显示为黄色），然后复制粘贴：
请问如何构建出图中的结构-7
请问如何构建出图中的结构-8
请问如何构建出图中的结构-9
方法二，将盒子分子模型变成孤立分子模型，然后复制粘贴如本回帖开头的步骤：
请问如何构建出图中的结构-10
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010-8393-9164
5楼2013-06-12 22:08:02
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DFPT

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by gong_107 at 2013-06-12 22:01:29
刚在google里搜了一下 居然说是有道的原因，它与MS5.5和以上的版本不兼容，我用的是5.5版本，把有道关了重启下MS就可以了，晕倒!

我也晕～不过还是强烈建议LZ的操作上也注意一下，是否有操作上的失误，虽然有道词典可能跟MS 5.5有冲突，但是不确定一定就有这样的复制问题。并且这个复制问题说得很清楚，不能把两个周期结构进行复制粘贴。
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010-8393-9164
6楼2013-06-12 22:10:22
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mingtao

金虫 (小有名气)
re啊re，不行就建一个non-periodic的结构。在build-菜单下。
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7楼2013-06-12 23:34:15
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gong_107

金虫 (小有名气)
送红花一朵
十分感谢 DFPT
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8楼2013-06-13 07:52:56
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