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zhuimeng08

银虫 (正式写手)

[求助] gromacs 中的gro文件的处理

我的gro文件中 UNK只有23个原子,但是用
make_ndx  查看结果成了73个,与此同时DPP少了50个,也就是UNK末端与DPP开头系统没有很好地识别开来,怎样才能把他们分开?
求助???
0 System              : 75223 atoms
  1 Protein             :  5646 atoms
  2 Protein-H           :  4411 atoms
  3 C-alpha             :   560 atoms
  4 Backbone            :  1680 atoms
  5 MainChain           :  2242 atoms
  6 MainChain+Cb        :  2764 atoms
  7 MainChain+H         :  2774 atoms
  8 SideChain           :  2872 atoms
  9 SideChain-H         :  2169 atoms
10 Prot-Masses         :  5646 atoms
11 non-Protein         : 69577 atoms
12 Other               : 25717 atoms
13 HEM                 :    94 atoms
14 UNK                 :    73 atoms
15 DPP                 : 25550 atoms
16 Water               : 43860 atoms
17 SOL                 : 43860 atoms
18 non-Water           : 31363 atoms
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