| 查看: 907 | 回复: 2 | ||
[求助]
gromacs蛋白模拟报错，，，求指导啊 已有2人参与
|
|
Fatal error: There is no domain decomposition for 10 nodes that is compatible with the given box and a minimum cell size of 1.09213 nm Change the number of nodes or mdrun option -rcon or -dds or your LINCS settings Look in the log file for details on the domain decomposition 在做一个蛋白的模拟，并行计算，提交了脚本后，在给出的MD.e23413文件里就是这样的错误，请大神指导，怎么回事啊，是我得盒子太小了？还是太大了？还是我用的节点太多了。。 |
回复此楼» 猜你喜欢
科研孤儿太难了
已经有15人回复
-
让我中一个面上吧！
已经有10人回复
-
言之凿凿，明天官网会通知放榜？
已经有17人回复
-
时间戳又变了
已经有17人回复
-
今天系统多次维护，明天很可能放榜！
已经有11人回复
-
时间戳变了，能看出什么问题？
已经有23人回复
-
只有每年这种时候来逛逛小木虫
已经有22人回复
-
放榜前的不淡定
已经有12人回复
-
重要消息，中午系统在维护
已经有12人回复
-
今天基金会出结果吗？20260819
已经有15人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 菜鸟。请问如何用gromacs模拟，水和油不容分层？？
已经有4人回复
- GROMACS运行完后的结果分析
已经有4人回复
- Gromacs中添加CHARMM力场
已经有41人回复
- gromacs无法生成gro文件
已经有5人回复
- gromacs安装出错求助
已经有4人回复
- gromacs NEMD模拟
已经有12人回复
- Gromacs 4.5.5安装记录
已经有5人回复
- gromacs，用pdb文件生成top文件时遇到的问题
已经有4人回复
- gromacs模拟分子在二氧化硅表面的吸附
已经有9人回复
- 如何使用gromacs进行多分子模拟？
已经有7人回复
- 请教GROMACS安装
已经有8人回复
- GROMACS 小分子top文件
已经有9人回复
- gromacs运行出错，求方案，谢谢！！！
已经有6人回复
- 求Gromacs中Glycam力场数据包。。非常感谢
已经有5人回复
- gromacs中文教程
已经有488人回复
- 【求助】如何使用gromacs中的constraint
已经有8人回复
- 【求助】怎样才能使整个盒子充满水,用gromacs
已经有6人回复
- 【求助】这是我安装gromacs过程，但是出错阿，这个怎么办呢？谢谢
已经有11人回复
- 【求助】GROMACS分析二面角随时间的变化
已经有4人回复
- 【原创】在gromacs的gro中插入小分子
已经有12人回复
fangsteel
木虫 (正式写手)
- 应助: 96 (初中生)
- 金币: 1215.1
- 散金: 32
- 红花: 22
- 帖子: 456
- 在线: 192.5小时
- 虫号: 2248690
- 注册: 2013-01-18
- 性别: GG
- 专业: 原子和分子物理
2楼2014-03-08 20:48:15
旺仔小馒头01
木虫 (正式写手)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 4917.2
- 红花: 13
- 帖子: 520
- 在线: 111.5小时
- 虫号: 1310118
- 注册: 2011-05-30
- 性别: GG
- 专业: 功能与智能高分子
3楼2014-03-09 10:17:02
40