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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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anyachan

木虫 (小有名气)

[求助] gromacs 复合物小分子的处理

gromacs中的复合物动力学模拟,用GROMOS96力场,很多地方说在PRODRG中处理小分子,之后还要改下电荷分布分组什么的,怎么改呀,如果不改有什么影响吗?
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xueer小雯

金虫 (初入文坛)


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-03-15 08:21:57
用高斯计算小分子电荷,再手动修改itp文件里的电荷,如果只用极性氢的化,把非极性氢的电荷合并到最近的重原子就可以啦。
2楼2014-03-14 10:40:31
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xueer小雯

金虫 (初入文坛)

用高斯计算小分子电荷,再手动修改itp文件里的电荷,如果只用极性氢的化,把非极性氢的电荷合并到最近的重原子就可以啦。
3楼2014-03-14 10:41:48
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