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GROMACS模拟蛋白质与小分子的复合体系
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| 请教各位大神，用GROMAC模拟蛋白质与药物的复合体系时，在讲义中，都是抽取蛋白质原先的配体进行模拟讲解，此配体都在蛋白质的内部。但是如果是新的蛋白和新的小分子进行模拟，VMD观察到小分子与蛋白质是有一定距离的，这样子是不是正确的呢？模拟完结果怎么分析？多谢多谢~~！ |
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