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yilanding

木虫 (著名写手)

[求助] 对肽酰转移酶的sybyl分子对接 已有1人参与

1.今天看了篇文章,其中一部分关于分子对接的。其中他使用一个抗生素去与肽酰转移酶对接,我也上试试。就用泰秒菌素去对接1XBP。但是发现1XBP由蛋白质和RNA组成,按官网上提供的视频只有对接蛋白质或DNA中一个的对接,就想将RNA作为配体去除,对蛋白质进行准备,愁吃配体,去除RNA后,结果发现只剩下一个个亮点不对可见下图1,想知道是为什么?
2.若果我的方法不对,应该怎么进行对接?
3.继续操作修复Repairbackbone发现一直出现图2,这是咋了
小弟才开始用sybyl,有很多不懂,感谢各位大侠帮助。。
对肽酰转移酶的sybyl分子对接
1.jpg


对肽酰转移酶的sybyl分子对接-1
2.jpg
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很傻
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smutao

禁虫 (著名写手)


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-02-19 21:14:35
本帖内容被屏蔽

2楼2014-02-19 19:04:04
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yilanding

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2014-02-19 19:04:04
检查一下蛋白质的presentation表现方式
调整为cartoon等试试

在哪找到presentation表现方式,找不到。
很傻
3楼2014-02-19 20:37:00
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