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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 求助：gromacs怎么修改运行时间？
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moye1991

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助：gromacs怎么修改运行时间？ 已有2人参与

向好心人求助：gromacs跑两个蛋白，样例命令和给的mdp文件执行出来是跑10ns，现在我想跑50ns，请问我该在哪个文件下做什么修改？急！！谢谢了！
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1楼 2014-02-18 14:06:48
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fangsteel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-02-18 18:28:23
moye1991: 金币+3, ★★★很有帮助, 好的，懂了，谢谢！ 2014-02-19 08:51:49
如果你还没有开始跑，那么你直接修改mdp文件，把你的step改成原来的5倍就行。如果你已经跑了10ns了还想续跑40ns。那直接用tpbconv命令中的-extend改tpr文件增加时间接着跑就行
赞一下(2人) 回复此楼
gromacs
3楼2014-02-18 18:23:39
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smutao

禁虫 (著名写手)
★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-02-18 18:28:14
moye1991: 金币+2, 好的，已经整明白了，谢谢！ 2014-02-19 08:51:11
本帖内容被屏蔽
2楼2014-02-18 17:24:41
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