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moye1991

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助:gromacs怎么修改运行时间? 已有2人参与

向好心人求助:gromacs跑两个蛋白,样例命令和给的mdp文件执行出来是跑10ns,现在我想跑50ns,请问我该在哪个文件下做什么修改?急!!谢谢了!
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smutao

禁虫 (著名写手)

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月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-02-18 18:28:14
moye1991: 金币+2, 好的,已经整明白了,谢谢! 2014-02-19 08:51:11
本帖内容被屏蔽

2楼2014-02-18 17:24:41
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fangsteel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-02-18 18:28:23
moye1991: 金币+3, ★★★很有帮助, 好的,懂了,谢谢! 2014-02-19 08:51:49
如果你还没有开始跑,那么你直接修改mdp文件,把你的step改成原来的5倍就行。如果你已经跑了10ns了还想续跑40ns。那直接用tpbconv命令中的-extend改tpr文件增加时间接着跑就行
gromacs
3楼2014-02-18 18:23:39
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