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liulugang

木虫 (小有名气)

[求助] 有关质粒提取的问题。。。急!!! 已有2人参与

小弟最近做red重组,用的质粒pkd46(6329bp),每次提完跑胶都在12000左右,应该是形成了二聚体,单酶切后跑胶大小正常。请问下:质粒形成二聚体会影响质粒上基因的表达吗?
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liulugang

木虫 (小有名气)

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2楼: Originally posted by yipan at 2014-02-18 13:24:38
细菌质粒是独立于细菌染色体的自主复制的环状双链DNA分子,只有酵母的杀伤质粒(killerplasmid)已知是RNA分子。环形双链DNA分子有三种构型。第一种是共价闭合环状DNA(covalently close circular DNA,ccc DNA),它的 ...

哥们,谢谢打了这么多,受教了。但是我想问的是:质粒这样形成二聚体会影响质粒上基因的表达吗?
3楼2014-02-18 14:17:20
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liulugang

木虫 (小有名气)

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6楼: Originally posted by XOooZzz at 2014-02-18 15:04:22
未必就是二聚体吧。
说不定你那看似12000的片段只是开环状态的质粒。

谢谢了。我每次只能提出12000大小的质粒,正常大小(6329)的就是提不出,这正常吗?
7楼2014-02-18 16:05:23
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liulugang

木虫 (小有名气)

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5楼: Originally posted by 朱多龙 at 2014-02-18 14:23:36
质粒自连一般会影响蛋白的表达,而且质粒自连后比较大,不太稳定,而且不容易电转化。你是需要表达那三个功能蛋白的,不建议用自连的质粒去实验。最好是用原先正确的质粒。如你所说可以将自连的质粒单切,单切后做 ...

谢谢了。
8楼2014-02-18 16:06:21
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liulugang

木虫 (小有名气)

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9楼: Originally posted by XOooZzz at 2014-02-18 16:33:17
你的意思是,取不同的转化子提质粒,质粒直接跑胶条带都在约12000的位置吗?
这里有一个问题。提取的质粒要么是超螺旋,要么是开环,基本没有线性化的,它们的电泳速度各不相同,所以这根本看不出质粒的大小啊.......

是的,所有的转化子都是12000的位置。那我需要单切后再连接,重新转化吗?
10楼2014-02-18 18:33:06
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liulugang

木虫 (小有名气)

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11楼: Originally posted by XOooZzz at 2014-02-18 20:25:30
如果是我就直接做后续实验了。
我是觉得,不可能所有转化子都正好形成“二聚体”的,即使有“二聚体”也只会是少数。但是我没有做过重组,不太了解细节,也许实验上某个意料之外的细节导致大量“二聚体”的产生? ...

好的,谢谢了
12楼2014-02-19 13:29:52
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