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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 请问如何用多个基因序列做整体的密码子使用情况分析?
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kentgrey

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问如何用多个基因序列做整体的密码子使用情况分析? 已有1人参与

我正在处理线粒体的数据，共有13个编码蛋白质的基因
目前已经知道如何用MEGA5做单个基因的密码子使用率和RSCU
但是请问如何做13个基因整体的密码子使用率？
就是13个基因做为一个整体的密码子使用率和RSCU
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1楼 2014-02-14 14:27:08
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unforget408

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-03-30 00:28:09
在编码区预测时计算预测准确率时，是取所有序列预测准确率的平均；所以你的问题是不是也可以取平均，或者把所有序列的结果累加后再算最后的结果,只要交代清楚采用哪种方法得到的结果就可以了。效果好的话还是个创新呢，哈哈
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2楼2014-02-20 15:02:38
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冷咖啡续杯

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by unforget408 at 2014-02-20 15:02:38
在编码区预测时计算预测准确率时，是取所有序列预测准确率的平均；所以你的问题是不是也可以取平均，或者把所有序列的结果累加后再算最后的结果,只要交代清楚采用哪种方法得到的结果就可以了。效果好的话还是个创新 ...

求问楼主解决了吗？我也面临这问题，急需答案
赞一下 回复此楼
3楼2018-09-02 20:25:24
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