应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 请教T-RFLP的数据分析方法？
261/3返回列表123下一页
查看: 2901  |  回复: 25
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

久久季雨

木虫 (正式写手)

[求助] 请教T-RFLP的数据分析方法？ 已有3人参与

想请教各位木虫们，T-RFLP的数据怎么处理，怎么判断能不能用？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
我就是我！带不了假面具
1楼 2014-01-03 17:35:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

j2

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
数据跟RDP数据库比较出结果。怎么叫能不能用？
赞一下(1人) 回复此楼
修炼ｉｎｇ，当虫仙……
2楼2014-01-04 09:22:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

j2

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
dllchina: 金币+2, 谢谢热心应助 2014-03-02 12:02:15
引用回帖:
3楼: Originally posted by 久久季雨 at 2014-01-04 10:23:14
因为我做出来的片段比较少。怎么对比啊，我试过了，不知道哪个forwardand reverse fragment 什么意思？什么结果是forward fragment？...

看你把荧光放上游引物还是下游引物了，上游就是f下游是r

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下(1人) 回复此楼
修炼ｉｎｇ，当虫仙……
4楼2014-01-05 08:51:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

j2

木虫 (正式写手)
★ ★
久久季雨(dllchina代发): 金币+2, 谢谢热心应助 2014-03-03 09:15:40
引用回帖:
6楼: Originally posted by tllcu at 2014-03-01 08:12:53
你好，我也正在用t-rflp，有一问题想请教，我现在遇到的问题是酶切之后跑不出条带，这个跟跑胶的条件有没有关系？...

可能是量少，看不出来，只看到弥散的一段，测序能测出来的
赞一下(1人) 回复此楼
修炼ｉｎｇ，当虫仙……
7楼2014-03-02 08:49:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

j2

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by woshizhufeng at 2014-08-21 10:11:45
你好！我现在的T-RFLP的结果出来了， 是双酶切，用http://mica.ibest.uidaho.edu/runtrflp.php分析数据。
引物和酶都需要自己输入，但是提交后，总是提示错误，是怎么回事，请指教...

是哪段引物加的标记？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下(1人) 回复此楼
修炼ｉｎｇ，当虫仙……
10楼2014-08-22 19:55:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

j2

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
11楼: Originally posted by woshizhufeng at 2014-08-23 09:39:10
上游引物标记的 Fam 标记...

mica上trflp有两个，选单标记那个。填入引物和酶，选择下面对应的库，导出来就好了。或者你可以用rdp那个网，给网络联系上留那个邮箱发邮件，把引物，酶，扩增的哪段基因，标记告诉他们，他们会回邮件提供给你数据，你自己分析就好了

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下(1人) 回复此楼
修炼ｉｎｇ，当虫仙……
12楼2014-08-23 11:55:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

j2

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

内容已删除
赞一下(1人) 回复此楼
修炼ｉｎｇ，当虫仙……
15楼2014-09-20 18:38:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

j2

木虫 (正式写手)
引用回帖:
16楼: Originally posted by woshizhufeng at 2014-09-24 22:22:31
我看文章里都要做这个 也是分析样品之间的差异吧...

样品间多样性的差异？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下(1人) 回复此楼
修炼ｉｎｇ，当虫仙……
17楼2014-09-26 21:55:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

woshizhufeng

新虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by j2 at 2014-08-22 19:55:56
是哪段引物加的标记？
...

是上游引物加的标记 选择的内切酶在mica里没有 需要自己输入 但是输入后就出现错误。着急啊，请您指教啊
赞一下(1人) 回复此楼
18楼2014-10-02 13:53:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

peterrjp

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

如果T-RFLP图很漂亮，峰又不太多，不同处理之间差异很明显，可以直接贴图，把每个峰的T-RF长度标上去方便在正文中讨论，最好在图注里标明每个峰代表什么生物。稳定同位素标记-密度梯度离心的T-RFLP结果适合这种图片呈现方法，很直观。
如果不符合上述要求，则需整理T-RFLP的原始数据，统计每个峰在每个样品中的峰高比例（即该T-RF在该样品的总峰高中所占比例）。然后做散点图或折线图呈现结果。
赞一下(1人) 回复此楼
19楼2014-10-25 15:27:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

久久季雨

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by j2 at 2014-01-04 09:22:14
数据跟RDP数据库比较出结果。怎么叫能不能用？

因为我做出来的片段比较少。怎么对比啊，我试过了，不知道哪个forwardand reverse fragment 什么意思？什么结果是forward fragment？
赞一下 回复此楼
我就是我！带不了假面具
3楼2014-01-04 10:23:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

久久季雨

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by j2 at 2014-01-05 08:51:52
看你把荧光放上游引物还是下游引物了，上游就是f下游是r
...

能不能加你QQ详细请教啊？
赞一下 回复此楼
我就是我！带不了假面具
5楼2014-01-05 17:37:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tllcu

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by j2 at 2014-01-04 09:22:14
数据跟RDP数据库比较出结果。怎么叫能不能用？

你好，我也正在用t-rflp，有一问题想请教，我现在遇到的问题是酶切之后跑不出条带，这个跟跑胶的条件有没有关系？
赞一下 回复此楼
6楼2014-03-01 08:12:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tllcu

木虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by j2 at 2014-03-02 08:49:18
可能是量少，看不出来，只看到弥散的一段，测序能测出来的...

你当初用什么条件电泳的呢，我指的是胶浓度、电泳电压和时间？
赞一下 回复此楼
8楼2014-03-03 08:01:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

woshizhufeng

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by j2 at 2014-01-05 08:51:52
看你把荧光放上游引物还是下游引物了，上游就是f下游是r
...

你好！我现在的T-RFLP的结果出来了， 是双酶切，用http://mica.ibest.uidaho.edu/runtrflp.php分析数据。
引物和酶都需要自己输入，但是提交后，总是提示错误，是怎么回事，请指教
赞一下 回复此楼
9楼2014-08-21 10:11:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 久久季雨 的主题更新
261/3返回列表123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +15 熊二想上岸 2026-04-04 15/750 2026-04-08 22:52 by 猪会飞
[考研] 285求调剂 +20 哦呦呼o 2026-04-04 20/1000 2026-04-08 22:23 by yutian743
[考博] 材料方向考博，求推荐 +3 言语aaa 2026-04-05 4/200 2026-04-08 22:22 by nxgogo
[考研] 324求调剂 +17 想上学求调 2026-04-03 17/850 2026-04-08 20:04 by 我减肥1
[考研] 273求调剂 +41 麦小叮当 2026-04-06 48/2400 2026-04-08 15:16 by screening
[考研] 一志愿211，化学学硕，310分，本科重点双非，求调剂 +10 努力奋斗112 2026-04-07 10/500 2026-04-08 15:01 by screening
[考研] 一志愿生物与医药，296分，求调剂 +14 66鹿 2026-04-03 16/800 2026-04-08 10:38 by tjzhao
[考研] 326分，一志愿沪9，求生物学调剂 +4 刘墨墨 2026-04-05 4/200 2026-04-08 06:22 by lijunpoly
[考研] 材料求调剂 +18 一样YWY 2026-04-05 18/900 2026-04-07 15:49 by dxlg
[考研] 一志愿安徽某211 0703化学总分339求调剂 +7 晚风不晚 2026-04-04 7/350 2026-04-06 14:06 by houyaoxu
[考研] 求调剂 +10 chenxrlkx 2026-04-05 10/500 2026-04-06 11:31 by 猪会飞
[考研] 求调剂 +7 张.1 2026-04-05 7/350 2026-04-05 20:40 by 啵啵啵0119
[考研] 308求调剂 +4 maverick^_^ 2026-04-03 4/200 2026-04-05 19:08 by 蓝云思雨
[考研] 考研生物学考A区211，初试322，科目生化和生物综合，求调剂 +6 。。。54 2026-04-03 6/300 2026-04-05 14:54 by JOKER0401
[考研] 男生，一志愿沪9生物学071000，初试308求调剂 +3 刘墨墨 2026-04-04 3/150 2026-04-05 08:26 by barlinike
[考研] 333求调剂 +12 wfh030413@ 2026-04-03 13/650 2026-04-04 21:02 by jj987
[考研] 求调剂 +3 ffyyu 2026-04-02 3/150 2026-04-04 19:03 by 蓝云思雨
[考研] 309求调剂 +6 刘刘刘1231 2026-04-02 7/350 2026-04-04 13:41 by liucky
[考研] 考研调剂 +3 Draa 2026-04-03 3/150 2026-04-03 17:37 by hgwz7468
[考研] 346求调剂 +5 郑诚乐 2026-04-02 5/250 2026-04-02 16:38 by SZW_UJN
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭