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久久季雨

木虫 (正式写手)

[求助] 请教T-RFLP的数据分析方法?已有3人参与

想请教各位木虫们,T-RFLP的数据怎么处理,怎么判断能不能用?
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我就是我!带不了假面具
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j2

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
数据跟RDP数据库比较出结果。怎么叫能不能用?
修炼ing,当虫仙……
2楼2014-01-04 09:22:14
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j2

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
dllchina: 金币+2, 谢谢热心应助 2014-03-02 12:02:15
引用回帖:
3楼: Originally posted by 久久季雨 at 2014-01-04 10:23:14
因为我做出来的片段比较少。怎么对比啊,我试过了,不知道哪个forwardand reverse fragment 什么意思?什么结果是forward fragment?...

看你把荧光放上游引物还是下游引物了,上游就是f下游是r

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
修炼ing,当虫仙……
4楼2014-01-05 08:51:52
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j2

木虫 (正式写手)

★ ★
久久季雨(dllchina代发): 金币+2, 谢谢热心应助 2014-03-03 09:15:40
引用回帖:
6楼: Originally posted by tllcu at 2014-03-01 08:12:53
你好,我也正在用t-rflp,有一问题想请教,我现在遇到的问题是酶切之后跑不出条带,这个跟跑胶的条件有没有关系?...

可能是量少,看不出来,只看到弥散的一段,测序能测出来的
修炼ing,当虫仙……
7楼2014-03-02 08:49:18
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j2

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by woshizhufeng at 2014-08-21 10:11:45
你好!我现在的T-RFLP的结果出来了, 是双酶切,用http://mica.ibest.uidaho.edu/runtrflp.php分析数据。
引物和酶都需要自己输入,但是提交后,总是提示错误,是怎么回事,请指教...

是哪段引物加的标记?

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修炼ing,当虫仙……
10楼2014-08-22 19:55:56
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j2

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
11楼: Originally posted by woshizhufeng at 2014-08-23 09:39:10
上游引物标记的 Fam 标记...

mica上trflp有两个,选单标记那个。填入引物和酶,选择下面对应的库,导出来就好了。或者你可以用rdp那个网,给网络联系上留那个邮箱发邮件,把引物,酶,扩增的哪段基因,标记告诉他们,他们会回邮件提供给你数据,你自己分析就好了

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修炼ing,当虫仙……
12楼2014-08-23 11:55:56
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j2

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

内容已删除
修炼ing,当虫仙……
15楼2014-09-20 18:38:19
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j2

木虫 (正式写手)

引用回帖:
16楼: Originally posted by woshizhufeng at 2014-09-24 22:22:31
我看文章里都要做这个 也是分析样品之间的差异吧...

样品间多样性的差异?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
修炼ing,当虫仙……
17楼2014-09-26 21:55:30
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