24小时热门版块排行榜    

查看: 2602  |  回复: 8

jfleer

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助关于生物多样性分析(bio-dap)

各位大神 最近小弟在研究土壤微生物群落
通过上海基康测序拿到16s t-rflp一些数据 包括片段长度和峰面积之类的
现在我想问一下 我这个数据先拿到网上https://secure.limnology.wisc.edu/trflp/index.jsp比对 看哪些片段是有效片段 再进行bio-dap算多样性指数行吗?因为样品测出来的片段峰高度都比较低 按它的说法峰高低与200的都不可信 那我的样就基本没有有效菌了 但通过上述网查到一些片段可能会对于某些菌种 所以这个比较迷茫 希望懂的教一下
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jfleer

新虫 (初入文坛)

求回复
2楼2012-05-14 22:53:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jfleer

新虫 (初入文坛)

?
3楼2012-05-15 10:24:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jfleer

新虫 (初入文坛)

.............................
4楼2012-05-17 08:39:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jfleer

新虫 (初入文坛)

..................................
5楼2012-05-22 11:54:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiadongliang

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

是否有效,要看峰型是否好,而不是仅以峰高来决定。
如果每个峰的质量都很高,或者说没有什么背景峰,信号低也是可以用的。也是可以用来进行后续分析的
6楼2012-05-24 12:25:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

elon1133

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

”研究土壤微生物群落“根据nature,science的方法,可以直接454测序V3或者V6
7楼2012-05-25 20:41:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vaivaiann

铜虫 (小有名气)

500p以上的舍去吧  不是200bp
8楼2012-08-29 10:08:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

龙小娴

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

同意5楼说法,同时想问楼主,T-RFLP得出的结果能确定哪种菌相似度是多少吗?我看到有论文这样写,不知道怎么得出来的,求交流
9楼2013-09-16 09:09:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jfleer 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料复试调剂 +3 学材料的点 2026-03-01 4/200 2026-03-02 00:07 by ccp273206157
[考研] 材料学硕318求调剂 +11 February_Feb 2026-03-01 13/650 2026-03-01 23:53 by ccp273206157
[考研] 292求调剂 +6 yhk_819 2026-02-28 6/300 2026-03-01 23:23 by 向上的胖东
[考研] 272求调剂 +6 田智友 2026-02-28 6/300 2026-03-01 21:40 by 公瑾逍遥
[考研] 0856求调剂285 +10 吕仔龙 2026-02-28 10/500 2026-03-01 21:37 by 公瑾逍遥
[考研] 274求调剂 +3 cgyzqwn 2026-03-01 6/300 2026-03-01 21:24 by cgyzqwn
[考研] 306分材料调剂 +4 chuanzhu川烛 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:48 by 无际的草原
[考研] 一志愿中南大学理学化学 +4 15779376950 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:00 by Fff-1
[考研] 0856材料求调剂 +11 hyf hyf hyf 2026-02-28 12/600 2026-03-01 18:57 by 18137688336
[考研] 291分工科求调剂 +9 science饿饿 2026-03-01 10/500 2026-03-01 18:55 by 18137688336
[考研] 295求调剂 +7 19171856320 2026-02-28 7/350 2026-03-01 18:54 by 18137688336
[考研] 材料学调剂 +9 提神豆沙包 2026-02-28 11/550 2026-03-01 18:15 by ms629
[考研] 328求调剂 +3 aaadim 2026-03-01 5/250 2026-03-01 17:29 by njzyff
[考研] 281求调剂 +4 2026计算机_诚心 2026-03-01 7/350 2026-03-01 17:20 by 2026计算机_诚心
[考研] 321求调剂一志愿东北林业大学材料与化工英二数二 +4 虫虫虫虫虫7 2026-03-01 7/350 2026-03-01 16:52 by caszguilin
[考研] 285求调剂 +8 满头大汗的学生 2026-02-28 8/400 2026-03-01 16:47 by caszguilin
[考研] 307求调剂 +5 wyyyqx 2026-03-01 5/250 2026-03-01 15:21 by Fff-1
[考研] 302材料工程求调剂 +4 Doleres 2026-03-01 5/250 2026-03-01 11:52 by liqiongjy
[考研] 调剂 +3 简木ChuFront 2026-02-28 3/150 2026-03-01 11:46 by 王伟要上岸啊
[硕博家园] 【博士招生】太原理工大学2026化工博士 +4 N1ce_try 2026-02-24 8/400 2026-02-26 08:40 by N1ce_try
信息提示
请填处理意见