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jfleer

新虫 (初入文坛)

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[求助] 求助关于生物多样性分析（bio-dap）

各位大神最近小弟在研究土壤微生物群落
通过上海基康测序拿到16s t-rflp一些数据包括片段长度和峰面积之类的
现在我想问一下我这个数据先拿到网上https://secure.limnology.wisc.edu/trflp/index.jsp比对看哪些片段是有效片段再进行bio-dap算多样性指数行吗？因为样品测出来的片段峰高度都比较低按它的说法峰高低与200的都不可信那我的样就基本没有有效菌了但通过上述网查到一些片段可能会对于某些菌种所以这个比较迷茫希望懂的教一下

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1楼2012-05-14 21:02:09

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vaivaiann

铜虫 (小有名气)

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500p以上的舍去吧不是200bp

8楼2012-08-29 10:08:35

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