应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 求助关于生物多样性分析（bio-dap）
91/1返回列表
查看: 2447  |  回复: 8
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

jfleer

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助关于生物多样性分析（bio-dap）

各位大神 最近小弟在研究土壤微生物群落
通过上海基康测序拿到16s t-rflp一些数据 包括片段长度和峰面积之类的
现在我想问一下 我这个数据先拿到网上https://secure.limnology.wisc.edu/trflp/index.jsp比对 看哪些片段是有效片段 再进行bio-dap算多样性指数行吗？因为样品测出来的片段峰高度都比较低 按它的说法峰高低与200的都不可信 那我的样就基本没有有效菌了 但通过上述网查到一些片段可能会对于某些菌种 所以这个比较迷茫 希望懂的教一下
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2012-05-14 21:02:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jfleer

新虫 (初入文坛)
求回复
回复此楼
2楼2012-05-14 22:53:00
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jfleer

新虫 (初入文坛)
?
3楼2012-05-15 10:24:51
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jfleer

新虫 (初入文坛)
.............................
赞一下 回复此楼
4楼2012-05-17 08:39:11
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jfleer

新虫 (初入文坛)
..................................
赞一下 回复此楼
5楼2012-05-22 11:54:03
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiadongliang

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

是否有效，要看峰型是否好，而不是仅以峰高来决定。
如果每个峰的质量都很高，或者说没有什么背景峰，信号低也是可以用的。也是可以用来进行后续分析的
赞一下 回复此楼
6楼2012-05-24 12:25:19
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

elon1133

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

”研究土壤微生物群落“根据nature，science的方法，可以直接454测序V3或者V6
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2012-05-25 20:41:19
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vaivaiann

铜虫 (小有名气)
500p以上的舍去吧  不是200bp
赞一下 回复此楼
8楼2012-08-29 10:08:35
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

龙小娴

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

同意5楼说法，同时想问楼主，T-RFLP得出的结果能确定哪种菌相似度是多少吗？我看到有论文这样写，不知道怎么得出来的，求交流
赞一下 回复此楼
9楼2013-09-16 09:09:33
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jfleer 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭