24小时热门版块排行榜    

查看: 3021  |  回复: 8

jfleer

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助关于生物多样性分析(bio-dap)

各位大神 最近小弟在研究土壤微生物群落
通过上海基康测序拿到16s t-rflp一些数据 包括片段长度和峰面积之类的
现在我想问一下 我这个数据先拿到网上https://secure.limnology.wisc.edu/trflp/index.jsp比对 看哪些片段是有效片段 再进行bio-dap算多样性指数行吗?因为样品测出来的片段峰高度都比较低 按它的说法峰高低与200的都不可信 那我的样就基本没有有效菌了 但通过上述网查到一些片段可能会对于某些菌种 所以这个比较迷茫 希望懂的教一下
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jfleer

新虫 (初入文坛)

2楼2012-05-14 22:53:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jfleer

新虫 (初入文坛)

?
3楼2012-05-15 10:24:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jfleer

新虫 (初入文坛)

.............................
4楼2012-05-17 08:39:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jfleer

新虫 (初入文坛)

..................................
5楼2012-05-22 11:54:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiadongliang

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

是否有效,要看峰型是否好,而不是仅以峰高来决定。
如果每个峰的质量都很高,或者说没有什么背景峰,信号低也是可以用的。也是可以用来进行后续分析的
6楼2012-05-24 12:25:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

elon1133

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

”研究土壤微生物群落“根据nature,science的方法,可以直接454测序V3或者V6
7楼2012-05-25 20:41:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vaivaiann

铜虫 (小有名气)

500p以上的舍去吧  不是200bp
8楼2012-08-29 10:08:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

龙小娴

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

同意5楼说法,同时想问楼主,T-RFLP得出的结果能确定哪种菌相似度是多少吗?我看到有论文这样写,不知道怎么得出来的,求交流
9楼2013-09-16 09:09:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jfleer 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:41 by eObJPa4gWmp6
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:21 by eObJPa4gWmp6
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:09 by eObJPa4gWmp6
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 4/200 2026-09-06 18:09 by eObJPa4gWmp6
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 6/300 2026-09-06 18:01 by eObJPa4gWmp6
[文学芳草园] 两块石头 +7 阿美_Lml888 2026-09-03 9/450 2026-09-06 17:48 by myrtle
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 3/150 2026-09-06 13:09 by eObJPa4gWmp6
[考博] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 4/200 2026-09-06 12:49 by eObJPa4gWmp6
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 3/150 2026-09-06 12:49 by eObJPa4gWmp6
[考博] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 j5mmowWXNWxv 2026-09-05 4/200 2026-09-06 12:29 by eObJPa4gWmp6
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 7/350 2026-09-06 11:20 by eObJPa4gWmp6
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题 +10 瞬息宇宙 2026-09-01 19/950 2026-09-06 11:15 by jiangxuan2004
[考研] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jPDp0sc2B7zQ 2026-09-05 4/200 2026-09-06 07:20 by E1iiBLMU2XnD
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 7ZYIEW2YWn72 2026-09-04 9/450 2026-09-06 06:00 by E1iiBLMU2XnD
[基金申请] 面上没中,邀请各位路过的虫友分析一下分数 +12 jackleilei 2026-09-03 13/650 2026-09-05 18:10 by fireguard
[文学芳草园] 初秋的晨风 +4 阿美_Lml888 2026-09-04 6/300 2026-09-05 13:51 by 阿美_Lml888
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +6 瞬息宇宙 2026-08-31 9/450 2026-09-05 13:11 by haizai99
[硕博家园] Ei源刊怎么投 +4 Fengshun9711 2026-09-04 4/200 2026-09-04 19:30 by 研途知予
[硕博家园] 哈尔滨工业大学韩晓军教授课题组招收2027年硕士推免生及博士研究生 +3 灯灯灯灯DDDD 2026-09-03 3/150 2026-09-03 21:22 by 科研皮皮猪
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
信息提示
请填处理意见