24小时热门版块排行榜    

查看: 3181  |  回复: 8

jfleer

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助关于生物多样性分析(bio-dap)

各位大神 最近小弟在研究土壤微生物群落
通过上海基康测序拿到16s t-rflp一些数据 包括片段长度和峰面积之类的
现在我想问一下 我这个数据先拿到网上https://secure.limnology.wisc.edu/trflp/index.jsp比对 看哪些片段是有效片段 再进行bio-dap算多样性指数行吗?因为样品测出来的片段峰高度都比较低 按它的说法峰高低与200的都不可信 那我的样就基本没有有效菌了 但通过上述网查到一些片段可能会对于某些菌种 所以这个比较迷茫 希望懂的教一下
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jfleer

新虫 (初入文坛)

求回复
2楼2012-05-14 22:53:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jfleer

新虫 (初入文坛)

?
3楼2012-05-15 10:24:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jfleer

新虫 (初入文坛)

.............................
4楼2012-05-17 08:39:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jfleer

新虫 (初入文坛)

..................................
5楼2012-05-22 11:54:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiadongliang

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

是否有效,要看峰型是否好,而不是仅以峰高来决定。
如果每个峰的质量都很高,或者说没有什么背景峰,信号低也是可以用的。也是可以用来进行后续分析的
6楼2012-05-24 12:25:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

elon1133

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

”研究土壤微生物群落“根据nature,science的方法,可以直接454测序V3或者V6
7楼2012-05-25 20:41:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vaivaiann

铜虫 (小有名气)

500p以上的舍去吧  不是200bp
8楼2012-08-29 10:08:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

龙小娴

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

同意5楼说法,同时想问楼主,T-RFLP得出的结果能确定哪种菌相似度是多少吗?我看到有论文这样写,不知道怎么得出来的,求交流
9楼2013-09-16 09:09:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jfleer 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 SX5mJmPWDfOO 2026-11-13 3/150 2026-11-14 13:35 by KXypaGgBBlw7
[论文投稿] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 uKOSCocCb6Fm 2026-11-12 6/300 2026-11-14 08:59 by dHydBGAkDh6v
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 10/500 2026-11-13 11:08 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 6/300 2026-11-13 11:04 by Equinoxhua
[考博] 27博士申请 +5 白白白ly 2026-11-09 5/250 2026-11-13 05:01 by wlf1982
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 4/200 2026-11-12 12:28 by ECLTXnJnRSXf
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-11 5/250 2026-11-12 11:44 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 9/450 2026-11-12 11:22 by HajghKOMynmz
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 czAiolzR0IJC 2026-11-10 6/300 2026-11-12 11:00 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 6/300 2026-11-12 10:41 by HajghKOMynmz
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 YHiw1gou1Eda 2026-11-10 6/300 2026-11-12 10:08 by HajghKOMynmz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +7 FChKX8meu1ds 2026-11-09 9/450 2026-11-12 10:03 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 FChKX8meu1ds 2026-11-09 8/400 2026-11-12 09:41 by HajghKOMynmz
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 9/450 2026-11-12 09:21 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 3/150 2026-11-12 08:26 by HajghKOMynmz
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 5/250 2026-11-12 08:15 by HajghKOMynmz
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 5/250 2026-11-12 06:14 by 9fOTqj074tIg
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 C6CRn66RYYXS 2026-11-10 5/250 2026-11-12 06:03 by 9fOTqj074tIg
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 FChKX8meu1ds 2026-11-09 8/400 2026-11-12 05:30 by 9fOTqj074tIg
[考博] 申请环境,微生物方向博士 +3 浅笑09 2026-11-08 3/150 2026-11-10 12:44 by 可淡不可忘
信息提示
请填处理意见