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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 请教T-RFLP的数据分析方法？
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久久季雨

木虫 (正式写手)

[求助] 请教T-RFLP的数据分析方法？ 已有3人参与

想请教各位木虫们，T-RFLP的数据怎么处理，怎么判断能不能用？
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我就是我！带不了假面具
1楼 2014-01-03 17:35:13
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peterrjp

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

如果T-RFLP图很漂亮，峰又不太多，不同处理之间差异很明显，可以直接贴图，把每个峰的T-RF长度标上去方便在正文中讨论，最好在图注里标明每个峰代表什么生物。稳定同位素标记-密度梯度离心的T-RFLP结果适合这种图片呈现方法，很直观。
如果不符合上述要求，则需整理T-RFLP的原始数据，统计每个峰在每个样品中的峰高比例（即该T-RF在该样品的总峰高中所占比例）。然后做散点图或折线图呈现结果。
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19楼2014-10-25 15:27:02
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j2

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
数据跟RDP数据库比较出结果。怎么叫能不能用？
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修炼ｉｎｇ，当虫仙……
2楼2014-01-04 09:22:14
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久久季雨

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by j2 at 2014-01-04 09:22:14
数据跟RDP数据库比较出结果。怎么叫能不能用？

因为我做出来的片段比较少。怎么对比啊，我试过了，不知道哪个forwardand reverse fragment 什么意思？什么结果是forward fragment？
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我就是我！带不了假面具
3楼2014-01-04 10:23:14
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j2

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
dllchina: 金币+2, 谢谢热心应助 2014-03-02 12:02:15
引用回帖:
3楼: Originally posted by 久久季雨 at 2014-01-04 10:23:14
因为我做出来的片段比较少。怎么对比啊，我试过了，不知道哪个forwardand reverse fragment 什么意思？什么结果是forward fragment？...

看你把荧光放上游引物还是下游引物了，上游就是f下游是r

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下(1人) 回复此楼
修炼ｉｎｇ，当虫仙……
4楼2014-01-05 08:51:52
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