【答案】应助回帖

11楼2014-08-23 09:39:10

j2

木虫 (正式写手)

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11楼: Originally posted by woshizhufeng at 2014-08-23 09:39:10
上游引物标记的 Fam 标记...

mica上trflp有两个，选单标记那个。填入引物和酶，选择下面对应的库，导出来就好了。或者你可以用rdp那个网，给网络联系上留那个邮箱发邮件，把引物，酶，扩增的哪段基因，标记告诉他们，他们会回邮件提供给你数据，你自己分析就好了

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修炼ｉｎｇ，当虫仙……

12楼2014-08-23 11:55:56

woshizhufeng

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10楼: Originally posted by j2 at 2014-08-22 19:55:56
是哪段引物加的标记？
...

是上游加的标记

13楼2014-09-16 16:30:10

woshizhufeng

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10楼: Originally posted by j2 at 2014-08-22 19:55:56
是哪段引物加的标记？
...

您好！请问T-RFP结果出来了怎么做相似性分析，我用NTSYS软件总出现错误，怎么回事，请指教，不胜感激。

14楼2014-09-20 10:01:08

j2

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15楼2014-09-20 18:38:19

woshizhufeng

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15楼: Originally posted by j2 at 2014-09-20 18:38:19
相似分析？是什么
...

我看文章里都要做这个也是分析样品之间的差异吧

16楼2014-09-24 22:22:31

j2

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16楼: Originally posted by woshizhufeng at 2014-09-24 22:22:31
我看文章里都要做这个也是分析样品之间的差异吧...

样品间多样性的差异？

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17楼2014-09-26 21:55:30

woshizhufeng

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10楼: Originally posted by j2 at 2014-08-22 19:55:56
是哪段引物加的标记？
...

是上游引物加的标记选择的内切酶在mica里没有需要自己输入但是输入后就出现错误。着急啊，请您指教啊

18楼2014-10-02 13:53:37

peterrjp

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【答案】应助回帖

如果T-RFLP图很漂亮，峰又不太多，不同处理之间差异很明显，可以直接贴图，把每个峰的T-RF长度标上去方便在正文中讨论，最好在图注里标明每个峰代表什么生物。稳定同位素标记-密度梯度离心的T-RFLP结果适合这种图片呈现方法，很直观。
如果不符合上述要求，则需整理T-RFLP的原始数据，统计每个峰在每个样品中的峰高比例（即该T-RF在该样品的总峰高中所占比例）。然后做散点图或折线图呈现结果。

19楼2014-10-25 15:27:02

张永婧1991

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12楼: Originally posted by j2 at 2014-08-23 11:55:56
mica上trflp有两个，选单标记那个。填入引物和酶，选择下面对应的库，导出来就好了。或者你可以用rdp那个网，给网络联系上留那个邮箱发邮件，把引物，酶，扩增的哪段基因，标记告诉他们，他们会回邮件提供给你数据 ...

我想请问一下，我做的是猪肠道微生物多样性，在MICA库上的pig microbial库上比对，单酶切，出来的菌很少，在RDP上又太多，我怎么才能筛选出菌种呢？我看文献上有人用GeneBank或者RDP II软件对比，可是一直找不到这些软件的下载方法。还有就是你说在RDP网站上直接给他们发邮件的话，回来的数据是一种片段对应很多种菌种的吗？

20楼2014-11-20 10:07:02