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woshizhufeng

新虫 (小有名气)

引用回帖:
10楼: Originally posted by j2 at 2014-08-22 19:55:56
是哪段引物加的标记?
...

上游引物标记的 Fam 标记
11楼2014-08-23 09:39:10
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j2

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
11楼: Originally posted by woshizhufeng at 2014-08-23 09:39:10
上游引物标记的 Fam 标记...

mica上trflp有两个,选单标记那个。填入引物和酶,选择下面对应的库,导出来就好了。或者你可以用rdp那个网,给网络联系上留那个邮箱发邮件,把引物,酶,扩增的哪段基因,标记告诉他们,他们会回邮件提供给你数据,你自己分析就好了

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
修炼ing,当虫仙……
12楼2014-08-23 11:55:56
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woshizhufeng

新虫 (小有名气)

引用回帖:
10楼: Originally posted by j2 at 2014-08-22 19:55:56
是哪段引物加的标记?
...

是上游加的标记
13楼2014-09-16 16:30:10
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woshizhufeng

新虫 (小有名气)

引用回帖:
10楼: Originally posted by j2 at 2014-08-22 19:55:56
是哪段引物加的标记?
...

您好! 请问T-RFP结果出来了 怎么做相似性分析,我用NTSYS软件总出现错误,怎么回事,请指教,不胜感激。
14楼2014-09-20 10:01:08
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j2

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

内容已删除
修炼ing,当虫仙……
15楼2014-09-20 18:38:19
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woshizhufeng

新虫 (小有名气)

引用回帖:
15楼: Originally posted by j2 at 2014-09-20 18:38:19
相似分析?是什么
...

我看文章里都要做这个 也是分析样品之间的差异吧
16楼2014-09-24 22:22:31
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j2

木虫 (正式写手)

引用回帖:
16楼: Originally posted by woshizhufeng at 2014-09-24 22:22:31
我看文章里都要做这个 也是分析样品之间的差异吧...

样品间多样性的差异?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
修炼ing,当虫仙……
17楼2014-09-26 21:55:30
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woshizhufeng

新虫 (小有名气)

引用回帖:
10楼: Originally posted by j2 at 2014-08-22 19:55:56
是哪段引物加的标记?
...

是上游引物加的标记 选择的内切酶在mica里没有 需要自己输入 但是输入后就出现错误。着急啊,请您指教啊
18楼2014-10-02 13:53:37
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peterrjp

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

如果T-RFLP图很漂亮,峰又不太多,不同处理之间差异很明显,可以直接贴图,把每个峰的T-RF长度标上去方便在正文中讨论,最好在图注里标明每个峰代表什么生物。稳定同位素标记-密度梯度离心的T-RFLP结果适合这种图片呈现方法,很直观。
如果不符合上述要求,则需整理T-RFLP的原始数据,统计每个峰在每个样品中的峰高比例(即该T-RF在该样品的总峰高中所占比例)。然后做散点图或折线图呈现结果。
19楼2014-10-25 15:27:02
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张永婧1991

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
12楼: Originally posted by j2 at 2014-08-23 11:55:56
mica上trflp有两个,选单标记那个。填入引物和酶,选择下面对应的库,导出来就好了。或者你可以用rdp那个网,给网络联系上留那个邮箱发邮件,把引物,酶,扩增的哪段基因,标记告诉他们,他们会回邮件提供给你数据 ...

我想请问一下,我做的是猪肠道微生物多样性,在MICA库上的pig microbial库上比对,单酶切,出来的菌很少,在RDP上又太多,我怎么才能筛选出菌种呢?我看文献上有人用GeneBank或者RDP II软件对比,可是一直找不到这些软件的下载方法。还有就是你说在RDP网站上直接给他们发邮件的话,回来的数据是一种片段对应很多种菌种的吗?
20楼2014-11-20 10:07:02
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