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久久季雨

木虫 (正式写手)

[求助] 请教T-RFLP的数据分析方法?已有3人参与

想请教各位木虫们,T-RFLP的数据怎么处理,怎么判断能不能用?
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张永婧1991

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
12楼: Originally posted by j2 at 2014-08-23 11:55:56
mica上trflp有两个,选单标记那个。填入引物和酶,选择下面对应的库,导出来就好了。或者你可以用rdp那个网,给网络联系上留那个邮箱发邮件,把引物,酶,扩增的哪段基因,标记告诉他们,他们会回邮件提供给你数据 ...

我想请问一下,我做的是猪肠道微生物多样性,在MICA库上的pig microbial库上比对,单酶切,出来的菌很少,在RDP上又太多,我怎么才能筛选出菌种呢?我看文献上有人用GeneBank或者RDP II软件对比,可是一直找不到这些软件的下载方法。还有就是你说在RDP网站上直接给他们发邮件的话,回来的数据是一种片段对应很多种菌种的吗?
20楼2014-11-20 10:07:02
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