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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 请教T-RFLP的数据分析方法？
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久久季雨

木虫 (正式写手)

[求助] 请教T-RFLP的数据分析方法？ 已有3人参与

想请教各位木虫们，T-RFLP的数据怎么处理，怎么判断能不能用？
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我就是我！带不了假面具
1楼 2014-01-03 17:35:13
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张永婧1991

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
12楼: Originally posted by j2 at 2014-08-23 11:55:56
mica上trflp有两个，选单标记那个。填入引物和酶，选择下面对应的库，导出来就好了。或者你可以用rdp那个网，给网络联系上留那个邮箱发邮件，把引物，酶，扩增的哪段基因，标记告诉他们，他们会回邮件提供给你数据 ...

我想请问一下，我做的是猪肠道微生物多样性，在MICA库上的pig microbial库上比对，单酶切，出来的菌很少，在RDP上又太多，我怎么才能筛选出菌种呢？我看文献上有人用GeneBank或者RDP II软件对比，可是一直找不到这些软件的下载方法。还有就是你说在RDP网站上直接给他们发邮件的话，回来的数据是一种片段对应很多种菌种的吗？
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20楼2014-11-20 10:07:02
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j2

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
数据跟RDP数据库比较出结果。怎么叫能不能用？
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修炼ｉｎｇ，当虫仙……
2楼2014-01-04 09:22:14
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久久季雨

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by j2 at 2014-01-04 09:22:14
数据跟RDP数据库比较出结果。怎么叫能不能用？

因为我做出来的片段比较少。怎么对比啊，我试过了，不知道哪个forwardand reverse fragment 什么意思？什么结果是forward fragment？
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我就是我！带不了假面具
3楼2014-01-04 10:23:14
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j2

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
dllchina: 金币+2, 谢谢热心应助 2014-03-02 12:02:15
引用回帖:
3楼: Originally posted by 久久季雨 at 2014-01-04 10:23:14
因为我做出来的片段比较少。怎么对比啊，我试过了，不知道哪个forwardand reverse fragment 什么意思？什么结果是forward fragment？...

看你把荧光放上游引物还是下游引物了，上游就是f下游是r

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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修炼ｉｎｇ，当虫仙……
4楼2014-01-05 08:51:52
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