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Enliz

银虫 (小有名气)

引用回帖:
19楼: Originally posted by peterrjp at 2014-10-25 15:27:02
如果T-RFLP图很漂亮,峰又不太多,不同处理之间差异很明显,可以直接贴图,把每个峰的T-RF长度标上去方便在正文中讨论,最好在图注里标明每个峰代表什么生物。稳定同位素标记-密度梯度离心的T-RFLP结果适合这种图片 ...

看了很多文献都说选取50-900bp或30-500bp等等的片段,但是又没有具体说出什么原因。请问一下,你的原始数据如何整理呢?选取片段有些什么要求呢?
21楼2015-03-21 23:53:37
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yelasisi

新虫 (小有名气)

引用回帖:
19楼: Originally posted by peterrjp at 2014-10-25 15:27:02
如果T-RFLP图很漂亮,峰又不太多,不同处理之间差异很明显,可以直接贴图,把每个峰的T-RF长度标上去方便在正文中讨论,最好在图注里标明每个峰代表什么生物。稳定同位素标记-密度梯度离心的T-RFLP结果适合这种图片 ...

你好,我想问,我的T-RFLP图还可以,但是峰比较多,我的实验室为了筛选优势菌,所以,我只想要个别峰,可以直接贴图表达吗?有8个样品的T-RFLP图,在写作中,求指导,谢谢!
22楼2015-07-25 09:59:08
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yelasisi

新虫 (小有名气)

引用回帖:
21楼: Originally posted by Enliz at 2015-03-21 23:53:37
看了很多文献都说选取50-900bp或30-500bp等等的片段,但是又没有具体说出什么原因。请问一下,你的原始数据如何整理呢?选取片段有些什么要求呢?...

同问,请问楼主解决这个问题了吗?还有一个问题,理论峰值和实验峰值之间,允许的误差是多少bp,有可靠性的文献指明这个问题吗?可否分享经验,正在学习中,求指导!
23楼2015-07-25 10:01:40
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yelasisi

新虫 (小有名气)

楼主解决问题了吗?求指导,正在分析这些数据,只是分析理论值和实验值的Distance,但是结果如何看待,尚不懂。
24楼2015-07-25 10:03:28
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aiLilyzhou

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by j2 at 2014-01-04 09:22:14
数据跟RDP数据库比较出结果。怎么叫能不能用?

有没有BIO-DAP软件或者genemarker软件
25楼2016-03-14 19:09:49
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超离子体

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
1楼: Originally posted by 久久季雨 at 2014-01-03 17:35:13
想请教各位木虫们,T-RFLP的数据怎么处理,怎么判断能不能用?

你的应该分析出来了吧,求教,如何分分析的?

发自小木虫Android客户端
26楼2017-03-19 16:59:08
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