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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 请教T-RFLP的数据分析方法？
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Enliz

银虫 (小有名气)
引用回帖:
19楼: Originally posted by peterrjp at 2014-10-25 15:27:02
如果T-RFLP图很漂亮，峰又不太多，不同处理之间差异很明显，可以直接贴图，把每个峰的T-RF长度标上去方便在正文中讨论，最好在图注里标明每个峰代表什么生物。稳定同位素标记-密度梯度离心的T-RFLP结果适合这种图片 ...

看了很多文献都说选取50-900bp或30-500bp等等的片段，但是又没有具体说出什么原因。请问一下，你的原始数据如何整理呢？选取片段有些什么要求呢？
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21楼2015-03-21 23:53:37
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yelasisi

新虫 (小有名气)
引用回帖:
19楼: Originally posted by peterrjp at 2014-10-25 15:27:02
如果T-RFLP图很漂亮，峰又不太多，不同处理之间差异很明显，可以直接贴图，把每个峰的T-RF长度标上去方便在正文中讨论，最好在图注里标明每个峰代表什么生物。稳定同位素标记-密度梯度离心的T-RFLP结果适合这种图片 ...

你好，我想问，我的T-RFLP图还可以，但是峰比较多，我的实验室为了筛选优势菌，所以，我只想要个别峰，可以直接贴图表达吗？有8个样品的T-RFLP图，在写作中，求指导，谢谢！
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22楼2015-07-25 09:59:08
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yelasisi

新虫 (小有名气)
引用回帖:
21楼: Originally posted by Enliz at 2015-03-21 23:53:37
看了很多文献都说选取50-900bp或30-500bp等等的片段，但是又没有具体说出什么原因。请问一下，你的原始数据如何整理呢？选取片段有些什么要求呢？...

同问，请问楼主解决这个问题了吗？还有一个问题，理论峰值和实验峰值之间，允许的误差是多少bp，有可靠性的文献指明这个问题吗？可否分享经验，正在学习中，求指导！
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23楼2015-07-25 10:01:40
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yelasisi

新虫 (小有名气)
楼主解决问题了吗？求指导，正在分析这些数据，只是分析理论值和实验值的Distance，但是结果如何看待，尚不懂。
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24楼2015-07-25 10:03:28
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aiLilyzhou

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by j2 at 2014-01-04 09:22:14
数据跟RDP数据库比较出结果。怎么叫能不能用？

有没有BIO-DAP软件或者genemarker软件
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25楼2016-03-14 19:09:49
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超离子体

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
1楼: Originally posted by 久久季雨 at 2014-01-03 17:35:13
想请教各位木虫们，T-RFLP的数据怎么处理，怎么判断能不能用？

你的应该分析出来了吧，求教，如何分分析的？

发自小木虫Android客户端
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26楼2017-03-19 16:59:08
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