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摩羯的心

铁虫 (小有名气)

[求助] PCR不同模板 退火温度不一样 已有2人参与

各位同仁,本人用基因组DNA进行PCR扩增,出现了一个很奇怪的现象,只是模板不是一块提取的,同样的引物,其他条件都一样,但是却在不同的退火温度处出现目的条带,有的在64度,有的在这个温度扩增不出来,而是在56度处出现目的条带,请问这是怎么一回事呢  希望大家指点迷津
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摩羯的心

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 海豚湾小鱼 at 2013-12-31 11:24:45
我觉得应该是非特异性扩增吧,扩增出来的片段很有可能不是你所想要的。原因有很多,你有提到模板质量可能不一样,这是原因之一。退火温度为引物和模板结合时候的温度参数,当50%的引物和互补序列表现为双链DNA分子时 ...

我将64度扩增的片段测序后是我要的目的片段
4楼2013-12-31 14:12:11
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查看全部 7 个回答

海豚湾小鱼

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+4, 鼓励交流 2013-12-31 12:44:37
我觉得应该是非特异性扩增吧,扩增出来的片段很有可能不是你所想要的。原因有很多,你有提到模板质量可能不一样,这是原因之一。退火温度为引物和模板结合时候的温度参数,当50%的引物和互补序列表现为双链DNA分子时的温度·它是影响PCR特异性的较重要因素。建议重复做下,看看是什么样的结果,或者把你扩增处理的片段去送测。
2楼2013-12-31 11:24:45
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achonghello

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-01-02 08:35:20
同意楼上的,估计是非特异性扩增
一般同样的引物无论什么模板都是差不多温度的。。。。
3楼2013-12-31 13:53:34
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海豚湾小鱼

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 摩羯的心 at 2013-12-31 14:12:11
我将64度扩增的片段测序后是我要的目的片段...

恩恩,能P出来自己想要的片段就好。出现别的带,应该是引物特异性不强,出现非特异性扩增了。
5楼2013-12-31 17:10:00
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