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君竹1974

铜虫 (初入文坛)

[求助] 琼脂糖电泳和OD230 OD 260 OD 280 已有4人参与

样品A        样品B
230nm        0.076        0.061
260nm        0.117        0.075
280nm        0.067        0.053
260/230        1.539        1.23
260/280        1.746        1.415
浓度(ng/μL 58.5        37.5


样品A和B的 260/230好低 还有B样品的260/280也好低 看得出来什么污染吗
图片中 照照片时候 起始点的槽切下去了 所以边缘都亮了 看不出来起始点究竟有无蛋白质和无机盐类,但是 最右边那条 是不是跑带严重 第一次做电泳。。
琼脂糖电泳和OD230  OD 260  OD 280
1.jpg
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君竹1974

铜虫 (初入文坛)

求助。。。

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2013-12-22 10:16:50
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badman20

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2013-12-22 13:55:01
你这是CTAB-硅珠吸附法做的吧?DNA有所讲解,但跑普通的PCR是没有问题的!
3楼2013-12-22 10:29:22
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不叶珏

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
些许蛋白污染
盐离子浓度也偏高

不过普通PCR 问题不大
借你一生好不好
4楼2013-12-22 14:01:36
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君竹1974

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by badman20 at 2013-12-22 10:29:22
你这是CTAB-硅珠吸附法做的吧?DNA有所讲解,但跑普通的PCR是没有问题的!

我是用试剂盒提取的  是想把DNA最后拿来测序

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2013-12-22 16:29:15
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君竹1974

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 不叶珏 at 2013-12-22 14:01:36
些许蛋白污染
盐离子浓度也偏高

不过普通PCR 问题不大

是不是最右边的蛋白污染比中间那条带严重

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2013-12-22 16:31:25
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woshishui916

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
1、提的是什么DNA啊?植物、动物、还是微生物?血液?组织?
2、你后续用于PCR,然后测序,影响不大;
3、盐离子和蛋白都偏多;
7楼2013-12-22 18:47:19
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梧桐柒夕

主管区长 (文坛精英)

优秀区长优秀区长优秀区长优秀区长优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你槽部分也是亮的,很明显,蛋白污染较为严重,DNA也有部分降解,都有弥散部分了。PCR没问题,可以继续做。
轻描淡写,浓墨重彩。
8楼2013-12-22 21:42:42
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badman20

木虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 君竹1974 at 2013-12-22 16:29:15
我是用试剂盒提取的  是想把DNA最后拿来测序
...

就用提出来的DNA拿去测序,还是做PCR扩增某一片断后测序?如果是直接的基因组测序应该不行,第一纯度不够,第二,浓度也不够;如果是PCR后测目的片断,那问题应该问题不大!
9楼2013-12-23 00:02:44
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君竹1974

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 梧桐柒夕 at 2013-12-22 21:42:42
你槽部分也是亮的,很明显,蛋白污染较为严重,DNA也有部分降解,都有弥散部分了。PCR没问题,可以继续做。

曹那是我切割成边缘曝光的。。。。

[ 发自小木虫客户端 ]
10楼2013-12-23 14:19:48
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