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张小逸

铜虫 (小有名气)

[求助] RNA提取结果分析 已有7人参与

提取了动物组织的RNA,28S和18S的条带很清晰,28比18也亮,并且无5S条带。但是在28S与点样孔之间有较亮条带,是否为DNA或蛋白污染?此RNA能否用于反转录,或继续下游PCR实验?
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
有时候没有5S是因为跑胶过长,EB往反方向跑,染色弱导致,一或电泳上样量不足

28S与点样孔之间有较亮条带,是genomic DNA的污染,最好先消化掉DNA,再进行后续的逆转录和PCR实验
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼2013-12-15 23:17:57
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laojiu9878

至尊木虫 (文坛精英)

九牛

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖交流! 2014-01-27 20:02:22
可能是蛋白质,多糖或者dna染料太多都会造成加样孔亮
但愿人长久
10楼2013-12-17 08:36:03
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普通回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2013-12-15 15:44:32
发个图片上来比较好。不管电泳时是否看得见gDNA,做反转录前都需要用DNase消化RNA。
2楼2013-12-15 13:08:41
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湖畔狂想

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2013-12-15 15:44:40
用什么方法提的?
3楼2013-12-15 14:33:41
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小木虫刘树青

木虫 (著名写手)

夜未眠

5S带可能降解了
世界上只有一种真正的英雄主义,那就是看清生活的真相之后,依然热爱生活。
4楼2013-12-15 20:14:19
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xv1215

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
能不能用于下面的实验还是测一下od值比较保险,1.8-2.0左右基本可用

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2013-12-16 08:21:24
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gastrodia

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
加样空量亮是蛋白污染,RNA提取的好与坏,除了胶图还要看260、280、230的比值。
7楼2013-12-16 08:46:12
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张小逸

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-12-15 13:08:41
发个图片上来比较好。不管电泳时是否看得见gDNA,做反转录前都需要用DNase消化RNA。

我用的Takara的 PrimeScript™ RT reagent Kit with gDNA Eraser(Perfect Real Time)试剂盒,里面的gDNA Eraser和5×gDNA Eraser Buffer反应42度2分钟,是不是就能很好的去除gDNA?
8楼2013-12-16 10:18:27
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 张小逸 at 2013-12-16 10:18:27
我用的Takara的 PrimeScript™ RT reagent Kit with gDNA Eraser(Perfect Real Time)试剂盒,里面的gDNA Eraser和5×gDNA Eraser Buffer反应42度2分钟,是不是就能很好的去除gDNA?...

没用过这个kit,不知道效果如何。gDNA是否完全消化干净要自己检测。
9楼2013-12-16 16:28:47
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