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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 如何把多条序列都转化成他们的反序列？（一共50000条，要求每条都反序）
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nmgyxx

新虫 (小有名气)

[求助] 如何把多条序列都转化成他们的反序列？（一共50000条，要求每条都反序）

如何把多条序列都转化成他们的反序列？（一共50000条，要求每条都反序）。例如：ATTTCGCGCCAAAAA转化后为：AAAAACCGCGCTTTA
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    • 2013-11-27 10:37:13, 67.62 M

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1楼 2013-11-27 10:37:30
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Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
wizardfan: 金币+1, thanks for posting 2013-11-27 20:07:02
http://emboss.bioinformatics.nl/
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2楼2013-11-27 13:45:31
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Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by Davidzjy at 2013-11-27 13:45:31
http://emboss.bioinformatics.nl/

EMBOSS是个很实用的工具 其中revseq（左边找）可以将序列倒过来
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3楼2013-11-27 13:46:55
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nmgyxx

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by Davidzjy at 2013-11-27 13:46:55
EMBOSS是个很实用的工具 其中revseq（左边找）可以将序列倒过来...

我试了一下出现错误了不知道为什么，麻烦您看看我的附件，可以直接在EMBOSS中上传然后revseq吗？谢谢
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4楼2013-11-27 15:08:32
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Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by nmgyxx at 2013-11-27 15:08:32
我试了一下出现错误了不知道为什么，麻烦您看看我的附件，可以直接在EMBOSS中上传然后revseq吗？谢谢...

出了什么错误？你不说我怎么知道。。。是不是除了reverse还选了complementary？
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5楼2013-11-27 15:43:46
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nmgyxx

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by Davidzjy at 2013-11-27 15:43:46
出了什么错误？你不说我怎么知道。。。是不是除了reverse还选了complementary？...

麻烦您帮我看一下吧，提交完就这样了
如何把多条序列都转化成他们的反序列？（一共50000条，要求每条都反序）
图片1.jpg
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6楼2013-11-27 19:02:07
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
6楼: Originally posted by nmgyxx at 2013-11-27 19:02:07
麻烦您帮我看一下吧，提交完就这样了

图片1.jpg
...

1. download emboss and install it locally
2. use the online version
3. use galaxy https://usegalaxy.org/ in the left top corner, search revseq
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7楼2013-11-27 20:06:44
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nannan5000

木虫 (正式写手)
感谢参与，应助指数 +1
wizardfan: 应助指数-1, 有代码才能算是应助 2013-11-30 00:57:06
俺可以给你写个小程序完成，很简单的
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追求卓越
8楼2013-11-28 15:52:12
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nmgyxx

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by nannan5000 at 2013-11-28 15:52:12
俺可以给你写个小程序完成，很简单的

那麻烦啦，求程序……
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9楼2013-11-28 16:52:22
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aylya025

木虫 (正式写手)
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wizardfan: 金币+2, 谢谢参与，不过回帖更倾向于交流，而不是应助，因为你不知道怎么批量 2013-11-30 00:57:38
wizardfan: 应助指数-1, 上次忘记减应助了 2013-11-30 00:58:02
DNAMAN也可以的，不过批量我就不知道该怎么做了
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10楼2013-11-29 16:27:29
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